Virulence and pathotype classification of <i>Plasmodiophora brassicae</i> populations collected from clubroot resistant canola (<i>Brassica napus</i>) in Canada
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Notice bibliographique
Résumé
Clubroot, caused by Plasmodiophora brassicae Wor., is an important soilborne disease of canola (Brassica napus L.) in Canada that is managed mainly by planting clubroot-resistant (CR) cultivars. Populations of P. brassicae representing 106 fields in Alberta were obtained from galled roots of CR canola plants collected in 2014–2016 and characterized for virulence on seven CR canola cultivars. Sixty-one of these populations could overcome resistance in at least one CR cultivar and were evaluated further by inoculation on 13 Brassica hosts termed the Canadian Clubroot Differential (CCD) Set. The CCD Set included the differentials of Williams and Somé et al., selected hosts of the European Clubroot Differential Set, and the B. napus cultivars ‘Brutor’, ‘Mendel’, ‘Westar’ and ‘45H29’. Each unique virulence pattern on the CCD Set represented a distinct pathotype and was identified with a letter. Five reference isolates, obtained prior to the introduction of CR canola, also were assessed. A total of 17 pathotypes were detected using the CCD Set, compared with five pathotypes using the system of Williams and two with the system of Somé et al., suggesting that the CCD Set has a greater differentiating capacity. Pathotype A, a variant of pathotype 3 (as per Williams) which is able to overcome the resistance in CR B. napus, was predominant. The original pathotype 3, which is avirulent on CR canola, was classified as CCD pathotype H. An integrated strategy, combining other tools in addition to resistance, will be needed for the sustainable management of clubroot.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle