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Enregistrement W2796381284 · doi:10.1101/265264

Homogenization of species composition and species association networks are decoupled

2018· preprint· en· W2796381284 sur OpenAlexaff
Daijiang Li, Timothée Poisot, Donald M. Waller, Benjamin Baiser

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2018
Typepreprint
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueEcology and Vegetation Dynamics Studies
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHomogenization (climate)EcologyPlant communityBiologyPlant speciesBiodiversitySpecies richnessComposition (language)Species diversityGeography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Ecological communities are comprised of both species and the biotic relationships among them. Biotic homogenization in species composition (i.e. increased site-to-site similarity) is recognized a common consequence of global change, but less is known about how species relationships change over space and time. Does homogenization of species composition lead to homogenization of species relationships or are the dynamics of species relationships decoupled from changes in species composition? To answer this question, we used long-term resurvey data to analyze changes in plant species association patterns between the 1950s and 2000s at 266 sites distributed among three community types in Wisconsin, USA. We used species associations (quantified via local co-occurrence patterns) as a proxy for species relationships. Species pairs that co-occur more/less than expected by chance have positive/negative associations. Shifts in species associations consistently exceeded the shifts observed in species composition. Less disturbed forests of northern Wisconsin have converged somewhat in species composition but not much in species associations. In contrast, forests in central Wisconsin succeeding from pine barrens to closed-canopy forests have strongly homogenized in both species composition and species associations. More fragmented forests in southern Wisconsin also tended to converge in species composition and in the species negative associations, but their positive associations diverged over the last half century. We conclude that long-term shifts in species relationships may be decoupled from those of species composition despite being affected by similar environmental variables.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,021

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,191
Écart entre enseignants0,183 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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