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Enregistrement W2796676652 · doi:10.1186/s12881-018-0565-1

MiR-146a G/C rs2910164 variation in South African Indian and Caucasian patients with psoriatic arthritis

2018· article· en· W2796676652 sur OpenAlexfundno aff
Ajesh B. Maharaj, Pragalathan Naidoo, Terisha Ghazi, Naeem Sheik Abdul, Shanel Dhani, Taskeen F. Docrat, Prithiksha Ramkaran, Paul‐Peter Tak, Niek de Vries, Anil A. Chuturgoon

Notice bibliographique

RevueBMC Medical Genetics · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSpondyloarthritis Studies and Treatments
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversity of Toronto
Mots-clésPsoriatic arthritisPsoriasisInternal medicineMedicineGastroenterologyAlleleImmunologyPathogenesisPopulationSingle-nucleotide polymorphismGenotypeBiologyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Psoriasis and psoriatic arthritis (PsA) are inflammatory associated autoimmune disorders. MicroRNA (miR)-146a plays a crucial role in regulating inflammation. A single nucleotide polymorphism in the miR-146a gene (rs2910164), aberrantly alters its gene expression and linked with the pathogenesis of several disorders, including psoriasis and PsA. In South Africa, psoriasis and PsA are extremely rare in the indigenous African population and most common in both the Indian and Caucasian population. The aim of this study was to investigate whether the miR-146a rs2910164 contributes towards psoriasis and PsA development in South African Indian and Caucasian patients. METHODS: South African Indian (n = 84) and Caucasian (n = 32) PsA patients (total n = 116) and healthy control subjects (Indian: n = 62 and Caucasian: n = 38; total n = 100) were recruited in the study. DNA was extracted from whole blood taken from all subjects, and genotyped for the miR-146a rs2910164 using polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP). Data for laboratory parameters were obtained from pathology reports. The consulting rheumatologist collected all other clinical data. RESULTS: Unstratified data (Caucasians + Indians): A significant decrease in C-reactive protein (CRP) levels in PsA patients was observed (CRP monitored at inclusion vs. after 6 months of treatment) (18.95 ± 2.81 mg/L vs. 9.68 ± 1.32 mg/L, p = 0.0011). The miR-146a rs2910164 variant C-allele frequency in PsA patients was significantly higher vs. healthy controls (35.78% vs. 26% respectively, p = 0.0295, OR = 1.59 95% CI 1.05-2.40). Stratified data (Indians): The variant C-allele frequency in Indian PsA patients was significantly higher vs. healthy Indian controls (35.71% vs. 22.58%, p = 0.0200, OR = 1.91 95% CI 1.13-3.22). Stratified data (Caucasians): The variant C-allele frequency distribution between Caucasian PsA patients and healthy Caucasian controls was similar. CONCLUSION: The rs2910164 variant C-allele may play a role in the progression of PsA in the South African Indian population. The main limitation in this study was the small sample size in the case-control cohorts, with a low overall statistical power (post-hoc power analysis = 19%).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,038
Score d'incertitude au seuil0,565

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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