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Enregistrement W2797018969 · doi:10.3354/dao03234

Histopathological, ultrastructural and molecular phylogenetic analysis of a novel microsporidium in a loggerhead sea turtle Caretta caretta

2018· article· en· W2797018969 sur OpenAlexaffabout
SA Martinson, Spencer J. Greenwood, D Wadowska, Karin Martin

Notice bibliographique

RevueDiseases of Aquatic Organisms · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueParasitic Infections and Diagnostics
Établissements canadiensUniversity of Prince Edward Island
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologySea turtlePolar filamentUltrastructureTurtle (robot)SporeZoologyPhylogenetic treeAnatomyMicrosporidiaFisheryMicrobiologyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Microsporidial spores were identified in the musculature of a loggerhead sea turtle Caretta caretta found dead on the shore in New Brunswick, Canada. Gastroenteritis was diagnosed on gross postmortem examination, with no gross abnormalities detected in the skeletal muscle. Histologically, the microsporidial spores were associated with inflammation and muscular necrosis and measured 1.1-1.7 × 2.2-3.4 µm. Spores were typically identified within sporophorous vesicles and, less often, in sporophorocysts and were weakly Gram positive, had punctate PAS staining, and were occasionally strongly acid-fast. Ultrastructural characteristics included 7-10 polar filament coils and other standard features of microsporidial spores. PCR for the microsporidial small subunit rRNA gene sequence was performed on DNA extracted from the muscle and small intestine, and the resulting amplicon was sequenced and queried against published microsporidial genomes. DNA sequences shared 98.2-99.8% sequence identity to Clade III of the Marinosporidia. This is the first report of a microsporidial infection contributing to the mortality of a sea turtle.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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