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Enregistrement W2797114171 · doi:10.1038/s41598-018-20719-0

Molecular and Functional Characterization of pheromone binding protein 1 from the Oriental Fruit Moth, Grapholita molesta (Busck)

2018· article· en· W2797114171 sur OpenAlexfundno aff
Guohui Zhang, Jian Chen, Haili Yu, Xiaoli Tian, Wu JunXiang

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeurobiology and Insect Physiology Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversity of WaterlooNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésPheromoneSex pheromoneBiologyStereochemistryBiochemistryBotanyChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pheromone binding protein (PBP) is thought primarily to bind and transport the sex pheromone in moths. The accumulated studies suggest that three PBPs were identified in moth species. In Grapholita molesta, the functions of GmolPBP2 and GmolPBP3 have been previously studied. However, the function of GmolPBP1 is still unclear. Furthermore, the Cydia pomonella sex pheromone Codlemone can act as a sex pheromone synergist of G. molesta. In C. pomonella, CpomPBP1 specifically bind the Codlemone. CpomPBP1 displays high identity with GmolPBP1 (70%), indicating that the two PBPs may share a similar 3D structure thus can bind the similar or same ligands. In this study, we explored the molecular and functional characterization of GmolPBP1. GmolPBP1, bearing the typical characteristics of Lepidopteran odorant binding proteins, was closest phylogenetically to CpomPBP1. Binding studies demonstrated that GmolPBP1 exhibited strong binding affinities with (Z)-8-dodecenyl alcohol, 1-dodecanol and Codlemone. Molecular docking showed that GmolPBP1 has different ligand recognition mechanism for the three ligands. Our results suggest that GmolPBP1 functions as recognizer of (Z)-8-dodecenyl alcohol and 1-dodecanol of the female sex pheromone blend, and may be the potential transporter of Codlemone, which contributes to the synergism of the pheromone response of G. molesta by Codlemone.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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