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Enregistrement W2797881282 · doi:10.14288/1.0349027

Investigating autophagy modulation in breast cancer

2020· article· en· W2797881282 sur OpenAlexaboutno aff
Svetlana Bortnik

Notice bibliographique

RevuecIRcle (University of British Columbia) · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAutophagy in Disease and Therapy
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBreast cancerAutophagyMedicineCancerBiologyInternal medicineGeneticsApoptosis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Autophagy, a lysosome-mediated degradation and recycling process that functions to promote stress adaptation and cell survival, is a promising novel target for anticancer therapy. Breast cancer, the most prevalent cancer and the 2nd leading cause of cancer deaths in Canadian women, consists of many diseases (intrinsic subtypes), which are all treated differently. Several studies indicate that some breast cancer subtypes might be more sensitive to autophagy inhibition than others. However, our knowledge of prognostic and predictive values of different autophagy-related biomarkers, as well as the effectiveness of autophagy inhibitors, in various breast cancer subtypes, essential for effective patient treatment selection and potentially better outcomes, is extremely limited. Using a tissue microarray from a large population-based cohort of breast cancer patients, we evaluated prognostic values of two autophagy proteins, the microtubule-associated protein 1 light chain 3B (MAP1LC3B, or LC3B), and a cysteine protease ATG4B, across different breast cancer subtypes. We found that LC3B expression was highest in triple-negative, in particular - basal-like, breast cancers, a group of malignancies characterized by an extremely aggressive course of disease, inferior survival, and limited treatment options. High LC3B expression was associated with adverse outcomes across all breast cancer subtypes. A potential drug target ATG4B demonstrated a poor prognostic value in HER2 positive breast cancers, but a favorable prognostic value in Luminal A breast cancers. Using in vitro and in vivo breast cancer models, we studied the roles of autophagy, in general, and ATG4B, in particular, in different breast cancer subtypes. We tested the possibility of sensitization of breast cancer cells to chemotherapy or targeted therapy by modulating autophagy. We showed that treatment with HCQ is a useful strategy to sensitize triple-negative breast cancer cells to chemotherapy and that ATG4B inhibition is a promising approach in combinational treatment of HER2 positive breast cancers. In conclusion, using a context-dependent approach to autophagy evaluation and modulation in breast cancers, we discovered novel associations with prognosis and sensitivity to treatment across various breast cancer subtypes. These findings should be taken into consideration when planning future pre-clinical and clinical studies with autophagy inhibitors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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