Isolation of y-Aminobutyrate (GABA) Utilizing Mutant Strains and Characterization of Factors Sufficient for GABA Utilization as a Carbon and Nitrogen Source
Notice bibliographique
Résumé
We have previously found that the 𝘨𝘢𝘣 operon of 𝘌𝘴𝘤𝘩𝘦𝘳𝘪𝘤𝘩𝘪𝘢 𝘤𝘰𝘭𝘪 is RpoS regulated suggesting that it plays an important role during stationary phase growth. The specific role of the 𝘨𝘢𝘣 operon is metabolism of γ-aminobutyrate (GABA). GABA, a four carbon amino acid, is the product of the glutamate decarboxylase reaction in 𝘌. 𝘤𝘰𝘭𝘪 and can serve as a source of carbon and nitrogen for members of the 𝘌𝘯𝘵𝘦𝘳𝘰𝘣𝘢𝘤𝘵𝘦𝘳𝘪𝘢𝘤𝘦𝘢𝘦. Interestingly, we found that we could isolate GABA utilizing mutants even when they carried mutations that were predicted to abolish gab function. However, we were only able to isolate GABA utilizing mutants in the 𝘳𝘱𝘰𝘚⁺ background. This suggests two additional features of GABA metabolism in 𝘌. 𝘤𝘰𝘭𝘪. One, that the 𝘨𝘢𝘣 operon in 𝘌𝘴𝘤𝘩𝘦𝘳𝘪𝘤𝘩𝘪𝘢 𝘤𝘰𝘭𝘪 is indeed dispensable for GABA utilization. Secondly, other RpoS regulated functions, independent of 𝘨𝘢𝘣-encoded functions, may allow the cell to metabolize GABA Finally, we have also investigated the inducing effects of GABA on 𝘨𝘢𝘣 expression in minimal and rich media and the role of glutamate in osmo-tolerance and acid adaptation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».