MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2798254748 · doi:10.3389/fphar.2018.00367

Association of STAT-3 rs1053004 and VDR rs11574077 With FOLFIRI-Related Gastrointestinal Toxicity in Metastatic Colorectal Cancer Patients

2018· article· en· W2798254748 sur OpenAlexafffund
Elena De Mattia, Erika Cecchin, Marcella Montico, Adrien Labriet, Chantal Guillemette, Eva Dreussi, Rossana Roncato, Alessia Bignucolo, Angela Buonadonna, Mario D’Andrea, Luigi Coppola, Sara Lonardi, Éric Lévesque, Derek J. Jonker, Félix Couture, Giuseppe Toffoli

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Pharmacology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer therapeutics and mechanisms
Établissements canadiensOttawa HospitalUniversity of OttawaUniversité LavalCentre hospitalier universitaire de Québec
Organismes subventionnairesEuropean Regional Development FundAssociazione Italiana per la Ricerca sul CancroProstate Cancer CanadaCanadian Institutes of Health ResearchUniversité Laval
Mots-clésFOLFIRIIrinotecanColorectal cancerMedicineInternal medicineOncologyPharmacologyCalcitriol receptorPharmacogeneticsPharmacogenomicsGastroenterologyBiologyCancerVitamin D and neurologyGenotypeGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pharmacogenomics has largely been applied to the personalization of irinotecan-based treatment, focusing mainly on the study of genetic variants in adsorption, distribution, metabolism, and excretion (ADME) genes. The transcriptional control of ADME gene expression is mediated by a set of nuclear factors responding to cancer-related inflammation, which could have pharmacological implications. The aim of the present study was to uncover novel genetic predictors of neutropenia and gastrointestinal toxicity risk among 246 haplotype-tagging polymorphisms in 22 genes encoding inflammation-related cytokines and transcriptional regulators of ADME genes. The study comprised overall more than 400 metastatic colorectal cancer (mCRC) patients treated with first-line FOLFIRI, grouped in a discovery and a replication cohorts. A concordant protective effect of STAT-3 rs1053004 polymorphism against the risk of grade 3-4 gastrointestinal toxicity was observed in both the cohorts of patients (OR=0.51, p=0.045, q=0.521 and OR=0.39, p=0.043, respectively). VDR rs11574077 polymorphism was demonstrated to affect both irinotecan biliary index and glucuronidation ratio by a pharmacokinetic analysis. This effect was consistent with an increased risk of grade 3-4 gastrointestinal toxicity in the discovery cohort (OR=4.46, p=0.010, q=0.305). The association was not significant in the replication cohort (OR=1.44, p=0.601). These findings suggest an effect of STAT-3 and VDR polymorphisms on FOLFIRI-related gastrointestinal toxicity. If prospectively validated as predictive markers, they could be used to improve the clinical management of mCRC.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,400
Score d'incertitude au seuil0,491

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueFrontiers in PharmacologyMême sujetCancer therapeutics and mechanismsTravaux en français237 207