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Enregistrement W2798782349 · doi:10.1101/308825

Fungal Bioaerosols at Five Dairy Farms: A Novel Approach to Describe Workers’ Exposure

2018· preprint· en· W2798782349 sur OpenAlexafffundabout
Hamza Mbareche, Marc Veillette, Guillaume J. Bilodeau, Caroline Duchaine

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2018
Typepreprint
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueIndoor Air Quality and Microbial Exposure
Établissements canadiensCanadian Food Inspection AgencyUniversité LavalInstitut universitaire de cardiologie et de pneumologie de Québec
Organismes subventionnairesFonds de recherche du Québec – Nature et technologiesInstitut de Recherche Robert-Sauvé en Santé et en Sécurité du Travail
Mots-clésIndoor bioaerosolBioaerosolCladosporiumPenicilliumAspergillusEnvironmental healthAspergillus fumigatusBiologyOccupational exposureBiotechnologyToxicologyVeterinary medicineMicrobiologyFood scienceMedicineEcologyGeographyAerosol

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Occupational exposure to harmful bioaerosols in industrial environments is a real treat to the workers. In particular, dairy-farm workers are exposed to high levels of fungal bioaerosols on a daily basis. Associating bioaerosol exposure and health problems is challenging and adequate exposure monitoring is a top priority for aerosol scientists. Using only culture-based tools do not express the overall microbial diversity and underestimate the large spectrum of microbes in bioaerosols and therefore the identification of new airborne etiological agents. The aim of this study was to provide an in-depth characterization of fungal exposure at Eastern Canadian dairy farms using qPCR and next-generation sequencing methods. Concentrations of Penicillium/Aspergillus ranged from 4.6 × 10 6 to 9.4 × 10 6 gene copies/m 3 and from 1 × 10 4 gene copies/m 3 to 4.8 × 10 5 gene copies/m 3 for Aspergillus fumigatus . Differences in the diversity profiles of the five dairy farms support the idea that the novel approach identifies a large number of fungal taxa. These variations may be explained by the presence of different and multiple sources of fungal bioaerosols at dairy farms. The presence of a diverse portrait of fungi in air may represent a health risk for workers who are exposed on a daily basis. In some cases, the allergen/infective activity of the fungi may not be known and can increase the risks to workers. The broad spectrum of fungi detected in this study includes many known pathogens and proves that adequate monitoring of bioaerosol exposure is necessary to evaluate and minimize risks. Importance While bioaerosols are a major concern for public health, accurately assessing human exposure is challenging. Highly contaminated environments, such as agricultural facilities, contain a broad diversity of aerosolized fungi that may impact human health. Effective bioaerosol monitoring is increasingly recognized as a strategic approach for achieving occupational exposure description. Workers exposure to diverse fungal communities is certain, as fungi are ubiquitous in the environments and the presence of potential sources increase their presence in the air. Applying new molecular approaches to describe occupational exposure is a necessary work around the traditional culture approaches and the biases they introduce to such studies. The importance of the newly developed approach can help to prevent worker’s health problems.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,293
Score d'incertitude au seuil0,583

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2018
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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