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Enregistrement W2799283128 · doi:10.3389/fncel.2018.00127

Molecular Characterization of an SV Capture Site in the Mid-Region of the Presynaptic CaV2.1 Calcium Channel C-Terminal

2018· article· en· W2799283128 sur OpenAlexafffund
Christine A. Snidal, Qi Li, Brittany B. Elliott, Henry K.-H. Mah, Robert HC Chen, Sabiha R. Gardezi, Elise F. Stanley

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Cellular Neuroscience · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensUniversity Health Network
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésVoltage-dependent calcium channelBinding siteCalcium channelGatingBiophysicsChemistryN-type calcium channelSynaptic vesicleCell biologyBiologyNeuroscienceCalciumBiochemistryVesicleT-type calcium channelMembrane

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Neurotransmitter is released from presynaptic nerve terminals at fast-transmitting synapses by the action potential-gating of voltage dependent calcium channels (CaV), primarily of the CaV2.1 and CaV2.2 types. Entering Ca2+ diffuses to a nearby calcium sensor associated with a docked synaptic vesicle (SV) and initiates its fusion and discharge. Our previous findings that single CaVs can gate SV fusion argued for one or more tethers linking CaVs to docked SVs, but the molecular nature of these tether have not been established. We recently developed a cell-free, in vitro biochemical assay, termed SV pull-down (SV-PD), to test for SV binding proteins and used this to demonstrate that CaV2.2 or the distal third of its C-terminal can capture SVs. In subsequent reports we identified the binding site and characterized an SV binding motif. In this study, we set out to test if a similar SV-binding mechanism exists in the primary presynaptic channel type, CaV2.1. We cloned the chick variant of this channel and to our surprise found that it lacked the terminal third of the C-terminal, ruling out direct correlation with CaV2.2. We used SV-PD to identify an SV binding site in the distal half of the CaV2.1 C-terminal, a region that corresponds to the central third of the CaV2.2 C-terminal. Mutant fusion proteins combined with motif-blocking peptide strategies identified two domains that could account for SV binding; one in an alternatively spliced region (E44) and a second more distal site. Our findings provide a molecular basis for CaV2.1 SV binding that can account for recent evidence of C-terminal-dependent transmitter release modulation and that may contribute to SV tethering within the CaV2.1 single channel Ca2+ domain.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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