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Enregistrement W2799304070 · doi:10.1002/tafs.10065

River‐Specific Gene Expression Patterns Associated with Habitat Selection for Key Hormone‐Coding Genes in Glass Eel‐Stage American Eels

2018· article· en· W2799304070 sur OpenAlexafffundabout
Mélanie Gaillard, Scott A. Pavey, Louis Bernatchez, Céline Audet

Notice bibliographique

RevueTransactions of the American Fisheries Society · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueReproductive biology and impacts on aquatic species
Établissements canadiensUniversité LavalUniversity of New BrunswickUniversité du Québec à Rimouski
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésIodothyronine deiodinaseEstuaryAnguilla rostrataBiologySalinityGeneThyroid hormone receptorHabitatBrackish waterProlactinHormoneEcologyZoologyEndocrinologyDeiodinaseTriiodothyronineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The glass eel stage of the American Eel Anguilla rostrata marks the onset of the catadromous migration into estuarine or freshwater habitats, and the endocrine mechanisms underlying this habitat selection are still not well understood. Using a candidate genes approach, the aim of this study was to test for different patterns of gene expression related to (1) salinity preferences and/or (2) capture site to predict physiological differences between migratory behaviors. We performed analyses revealing the expression of genes coding for key hormonal factors or their receptors on glass eel‐stage American Eels collected at the mouths of three rivers on the east coast of Canada (Grande‐Rivière‐Blanche, St. Lawrence estuary; Rivière‐Saint‐Jean, Gaspé Peninsula; and the Mersey River, Nova Scotia); eels from the three systems displayed different salinity preferences (brackish water/salt water/freshwater) under laboratory conditions. Transcripts from genes coding for prolactin (PRL), thyroid‐stimulating hormone β subunit, type‐2 iodothyronine deiodinase (DIO‐2), thyroid hormone receptors αa and αb (THRαa and THRαb), growth hormone (GH), insulin‐like growth factor 1 (IGF‐1), and their respective receptors (GH‐R1 and IGF‐1R) were all detected in glass eels. No differences in the expression patterns were detected pertaining to salinity preference, but strong differences were found among rivers. Rivière‐Saint‐Jean glass eels, which were the longest and the least pigmented among the three rivers, were characterized by the highest expression of PRL, DIO‐2, and THRαb. Those from Grande‐Rivière‐Blanche showed an increase in IGF‐1R. Glass eels captured from these two rivers also exhibited the highest expression of GH and GH‐R1. Overall, these results confirm gene × environment interactions at the gene expression level when glass eels settle into their continental habitat. As such, our results also support the concept of the presence of different ecotypes in the Atlantic Canadian coast and in the estuary and Gulf of St. Lawrence.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,027

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2018
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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