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Enregistrement W2799345614 · doi:10.1002/jbm.a.36444

Comparative proteomic analyses of human adipose extracellular matrices decellularized using alternative procedures

2018· article· en· W2799345614 sur OpenAlexaff
Caasy Thomas‐Porch, Jie Li, Fabiana Zanata, Elizabeth C. Martin, Nicholas C. Pashos, Kaylynn J. Genemaras, J. Nicholas Poche, Nicholas Totaro, Melyssa R. Bratton, Dina Gaupp, Trivia Frazier, Xiying Wu, Lydia Masako Ferreira, Weidong Tian, Guangdi Wang, Bruce A. Bunnell, Lauren E. Flynn, Daniel Hayes, Jeffrey M. Gimble

Notice bibliographique

RevueJournal of Biomedical Materials Research Part A · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTissue Engineering and Regenerative Medicine
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Institute of General Medical SciencesNutrition Obesity Research Center, University of North CarolinaNational Institute on Minority Health and Health DisparitiesChina Scholarship CouncilCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorNational Institutes of HealthMusculoskeletal Transplant Foundation
Mots-clésDecellularizationMaterials scienceAdipose tissueBiomedical engineeringExtracellular matrixExtracellularTissue engineeringBiologyCell biologyBiochemistryEngineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Decellularized human adipose tissue has potential clinical utility as a processed biological scaffold for soft tissue cosmesis, grafting, and reconstruction. Adipose tissue decellularization has been accomplished using enzymatic‐, detergent‐, and/or solvent‐based methods. To examine the hypothesis that distinct decellularization processes may yield scaffolds with differing compositions, the current study employed mass spectrometry to compare the proteomes of human adipose‐derived matrices generated through three independent methods combining enzymatic‐, detergent‐, and/or solvent‐based steps. In addition to protein content, bioscaffolds were evaluated for deoxyribose nucleic acid depletion, extracellular matrix composition, and physical structure using optical density, histochemical staining, and scanning electron microscopy. Mass spectrometry based proteomic analyses identified 25 proteins (having at least two peptide sequences detected) in the scaffolds generated with an enzymatic approach, 143 with the detergent approach, and 102 with the solvent approach, as compared to 155 detected in unprocessed native human fat. Immunohistochemical detection confirmed the presence of the structural proteins actin, collagen type VI, fibrillin, laminin, and vimentin. Subsequent in vivo analysis of the predominantly enzymatic‐ and detergent‐based decellularized scaffolds following subcutaneous implantation in GFP+ transgenic mice demonstrated that the matrices generated with both approaches supported the ingrowth of host‐derived adipocyte progenitors and vasculature in a time dependent manner. Together, these results determine that decellularization methods influence the protein composition of adipose tissue‐derived bioscaffolds. © 2018 Wiley Periodicals, Inc. J Biomed Mater Res Part A: 106A:2481–2493, 2018.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,000
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,220
Tête enseignante GPT0,487
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations49
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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