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Enregistrement W2800275773 · doi:10.1186/s13287-018-0881-6

Generation of three-dimensional human neuronal cultures: application to modeling CNS viral infections

2018· article· en· W2800275773 sur OpenAlexaff
Leonardo D’Aiuto, Jennifer N. Naciri, Nicholas M. Radio, Sesha Tekur, Dennis R. Clayton, Gerard Apodaca, Roberto Di Maio, Yun Zhi, Peter Dimitrion, Paolo Piazza, Matthew Demers, Joel Wood, Charleen T. Chu, Jason Callio, Lora McClain, Robert H. Yolken, James McNulty, Paul R. Kinchington, David C. Bloom, Vishwajit L. Nimgaonkar

Notice bibliographique

RevueStem Cell Research & Therapy · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVirus-based gene therapy research
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesNational Institute on AgingAvid RadiopharmaceuticalsSanofi GenzymeAllerganNational Institutes of HealthH. Lundbeck A/SStanley Medical Research InstituteNational Institute of Neurological Disorders and StrokePittsburgh Center for Kidney Research, University of PittsburghTeva Pharmaceutical IndustriesSanofiBiogenGlaxoSmithKlineServierGenentechUniversity of PittsburghNational Institute of Mental HealthPfizerEli Lilly and CompanyBristol-Myers SquibbNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesMichael J. Fox Foundation for Parkinson's Research
Mots-clésInduced pluripotent stem cellBiologyHerpes simplex virusDrug discoveryIn vivoFlow cytometryCentral nervous systemNeuroscienceStem cellVirologyImmunologyVirusCell biologyEmbryonic stem cellBioinformaticsGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: A variety of neurological disorders including neurodegenerative diseases and infection by neurotropic viruses can cause structural and functional changes in the central nervous system (CNS), resulting in long-term neurological sequelae. An improved understanding of the pathogenesis of these disorders is important for developing efficacious interventions. Human induced pluripotent stem cells (hiPSCs) offer an extraordinary window for modeling pathogen-CNS interactions, and other cellular interactions, in three-dimensional (3D) neuronal cultures that can recapitulate several aspects of in vivo brain tissue. METHODS: Herein, we describe a prototype of scaffold-free hiPSC-based adherent 3D (A-3D) human neuronal cultures in 96-well plates. To test their suitability for drug screening, A-3D neuronal cultures were infected with herpes simplex virus type 1 (HSV-1) with or without acyclovir. RESULTS: The half maximal inhibitory concentration (IC50) of acyclovir was 3.14 μM and 3.12 μM determined using flow cytometry and the CX7 High Content Screening platform, respectively. CONCLUSIONS: Our A-3D neuronal cultures provide an unprecedented opportunity for high-content drug screening programs to treat human CNS infections.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,096
Tête enseignante GPT0,391
Écart entre enseignants0,295 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations44
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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