MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2800317565 · doi:10.2196/publichealth.8214

Causality Patterns for Detecting Adverse Drug Reactions From Social Media: Text Mining Approach

2018· article· en· W2800317565 sur OpenAlexvenueno aff
Danushka Bollegala, Simon Maskell, R. J. Sloane, Joanna Hajne, Munir Pirmohamed

Notice bibliographique

RevueJMIR Public Health and Surveillance · 2018
Typearticle
Langueen
DomainePharmacology, Toxicology and Pharmaceutics
ThématiquePharmacovigilance and Adverse Drug Reactions
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInnovative Medicines InitiativeMedical Research CouncilNational Institute for Health and Care Research
Mots-clésCausality (physics)Set (abstract data type)Adverse drug reactionComputer scienceSocial mediaDrugData miningDrug reactionReliability (semiconductor)PharmacovigilanceArtificial intelligenceMachine learningMedicinePharmacology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Detecting adverse drug reactions (ADRs) is an important task that has direct implications for the use of that drug. If we can detect previously unknown ADRs as quickly as possible, then this information can be provided to the regulators, pharmaceutical companies, and health care organizations, thereby potentially reducing drug-related morbidity and saving lives of many patients. A promising approach for detecting ADRs is to use social media platforms such as Twitter and Facebook. A high level of correlation between a drug name and an event may be an indication of a potential adverse reaction associated with that drug. Although numerous association measures have been proposed by the signal detection community for identifying ADRs, these measures are limited in that they detect correlations but often ignore causality. OBJECTIVE: This study aimed to propose a causality measure that can detect an adverse reaction that is caused by a drug rather than merely being a correlated signal. METHODS: To the best of our knowledge, this was the first causality-sensitive approach for detecting ADRs from social media. Specifically, the relationship between a drug and an event was represented using a set of automatically extracted lexical patterns. We then learned the weights for the extracted lexical patterns that indicate their reliability for expressing an adverse reaction of a given drug. RESULTS: Our proposed method obtains an ADR detection accuracy of 74% on a large-scale manually annotated dataset of tweets, covering a standard set of drugs and adverse reactions. CONCLUSIONS: By using lexical patterns, we can accurately detect the causality between drugs and adverse reaction-related events.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Études des sciences et des technologies
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,816
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0020,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,174
Tête enseignante GPT0,447
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations42
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJMIR Public Health and SurveillanceMême sujetPharmacovigilance and Adverse Drug ReactionsTravaux en français237 207