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Enregistrement W2800520690 · doi:10.1111/1365-2745.12957

Exploring the performance of intransitivity indices in predicting coexistence in multispecies systems

2018· article· en· W2800520690 sur OpenAlexafffund
Robert A. Laird, Brandon S. Schamp

Notice bibliographique

RevueJournal of Ecology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant and animal studies
Établissements canadiensAlgoma UniversityUniversity of Lethbridge
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésSpecies richnessCompetition (biology)Extinction (optical mineralogy)Transitive relationVariation (astronomy)Network topologyMonocultureEcologyTournamentEconometricsMathematicsBiologyComputer scienceCombinatoricsPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Recent evidence suggests that intransitive competition (as in the game “rock‐paper‐scissors,” and in contrast to transitive or hierarchical competition) may be common in natural plant communities. This is important as theoretical analyses indicate that intransitivity promotes species coexistence. However, while intransitivity is common, competitive relationships among many species in communities may vary from transitive to highly intransitive. With increasing numbers of species, variation in competitive interrelationships among species can take on vastly more variable topologies. Consequently, several indices can be used to capture topological variation that is relevant to the prediction of species coexistence. Different indices capture different elements of topological variation. In addition, evidence indicates that these indices vary in their capacity to predict coexistence, and that variation not captured by these indices also contributes to variation in species coexistence. We used aspatial and spatial competition models to explore how well different indices (Slater's i , Kendall and Babington Smith's d , Monsuur and Storcken's ν, Bezembinder's ρ and Bezembinder's δ′, plus two binary indices we call “unbeatability” [ u ] and “always‐beatability” [ a ]) predict coexistence under the full spectrum of competitive tournament topologies for three to eight species, and a large sample of existing tournament topologies for nine species. All indices explored were generally better at predicting short‐term coexistence (i.e. the number of generations until the first extinction) compared to long‐term coexistence (i.e. generations until monoculture or long‐term species richness in aspatial and spatial models respectively). Indices also differed in performance: Kendall and Babington Smith's d (a measure of the number intransitive cycles among an assemblage's three‐species subsets that has also been reformulated as the relative intransitivity index) was the best predictor of short‐term coexistence; in terms of long‐term coexistence, the best predictor was typically d or u , the latter indicating the presence or absence of a species capable of outcompeting all its competitors. Synthesis . The indices employed here capture different elements of topological variation. Existing indices that capture aspects of intransitive competition vary in their capacity to predict coexistence in competition models. The more continuous nature of Kendall and Babington Smith's d index likely contributed to its robust performance; likewise, the ability of unbeatability to detect intransitivities involving the strongest competitors helps explain its success.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,035
Score d'incertitude au seuil0,794

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,130
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,103 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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