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Enregistrement W2800589777 · doi:10.1676/16-126.1

Species limits in the Rusty-breasted Antpitta ( <i>Grallaricula ferrugineipectus</i> ) complex

2018· article· en· W2800589777 sur OpenAlexaff
Benjamin M. Van Doren, Benjamin G. Freeman, Natalia Aristizábal, Mauricio Alvarez-R, Jorge L. Pérez‐Emán, Andrés M. Cuervo, Gustavo A. Bravo

Notice bibliographique

RevueThe Wilson Journal of Ornithology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAnimal Vocal Communication and Behavior
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPolyphylyBiologyAllopatric speciationGeographyEcologyZoologyCladeEvolutionary biologyPopulationDemographyPhylogenetic tree

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Rusty-breasted Antpitta (Grallaricula ferrugineipectus) is widely distributed within the tropical Andes of South America. We analyzed 73 study specimens, 25 vouchered tissue samples, and 123 audio recordings to assess geographic variation in genetics, vocalizations, and morphology and evaluate species limits. We found that Grallaricula ferrugineipectus as currently defined is polyphyletic because populations from Colombia and Venezuela form a clade closely related to Andean populations of G. nana, whereas populations from Peru and Bolivia are recovered as sister to G. lineifrons. Birds in Colombia and Venezuela (the northern group) last shared a common ancestor with birds from Peru and Bolivia (the southern group) more than 10 million years ago. Northern and southern groups additionally differ in song, suggesting they may have evolved substantial premating reproductive isolation. Discriminant function analysis reliably distinguished songs from northern and southern groups in multivariate acoustic space, but univariate analyses found non-overlapping acoustic variation between northern and southern groups in only one trait: mean note maximum frequency (and other correlated measures of song pitch). This finding suggests that the ‘three-trait' threshold for using vocalizations to inform species limits, which was developed for another suboscine group, the antbirds (Thamnophilidae), may be conservative when applied to antpittas (Grallariidae). In addition, we document apparent clinal variation in song pace within the southern group, a rare example of a suboscine with geographic clinal variation in a vocal trait. Finally, we show that northern and southern groups differ markedly in morphology. In summary, northern and southern groups of Rusty-breasted Antpittas are divergent in genetics, vocalizations, and morphology, demonstrating that these taxa are best classified as 2 monophyletic, biological species with allopatric distributions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,914
Score d'incertitude au seuil0,265

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,065
Tête enseignante GPT0,318
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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