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Enregistrement W2800629784 · doi:10.14740/cr687w

Molecular Diagnosis of Bacterial Definite Infective Endocarditis by Real-Time Polymerase Chain Reaction

2018· article· en· W2800629784 sur OpenAlexvenueno aff
Reza Faraji, Mostafa Behjati‐Ardakani, Nooshin Faraji, Seyed Mohammad Moshtaghioun, Seyed Mehdi Kalantar, Ali Pedarzadeh, Hengameh Zandi, Mohammadtaghi Sarebanhassanabadi, Nastaran Ahmadi, Ali Dehghani Firoozabadi

Notice bibliographique

RevueCardiology Research · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInfective Endocarditis Diagnosis and Management
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesShahid Sadoughi University of Medical Sciences
Mots-clésStreptococcus salivariusStreptococcusInfective endocarditisMedicineStreptococcus bovisMicrobiologyWhole bloodPolymerase chain reactionBlood cultureReal-time polymerase chain reactionBacteriaEnterococcus faecalisStaphylococcus aureusStreptococcus sanguinisViridans streptococciEnterococcusEndocarditisPrimer (cosmetics)16S ribosomal RNAInternal medicineBiologyStreptococcus mutansAntibioticsFood scienceChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Infective endocarditis (IE) can be diagnosed using the Duke criteria, which cannot be conclusive especially when the results of blood cultures are negative. This study aimed at using real-time polymerase chain reaction (PCR) technique to isolate bacteria present in whole blood samples of patients with definitive IE on the basis of the method designed in this study. This laboratory and test study was conducted on 20 whole blood samples taken from patients with definitive IE. Real-time PCR of the 16s rRNA was utilized to directly analyze whole blood samples to diagnose bacterial IE. Of 20 whole blood samples with definitive IE, only one blood culture (5%) was positive and the isolated bacterium belonged to Streptococci viridans group. Also, 13 whole blood samples were positive using real-time PCR technique. The isolated bacteria were Enterococcus faecalis with seven (35%) cases, Streptococcus gallolyticus with two (10%) cases, Streptococcus mutans with one (5%) case, Streptococcus sanguinis with one (5%) case, Streptococcus salivarius with one (5%) case, and Staphylococcus aureus with one (5%) case. Sensitivity, specificity, positive predictive value (PPV), and negative predictive value (NPV) using real-time PCR technique were 65%, 100%, 100%, and 74%, respectively. The developed real-time PCR method allows us to detect bacteria in whole blood samples and is much more sensitive than culturing method. It also permits the differentiation of the main group of bacteria within a few hours for IE. Cardiol Res. 2018;9(2):99-106 doi: https://doi.org/10.14740/cr687w

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,372
Score d'incertitude au seuil0,874

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,350
Écart entre enseignants0,321 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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