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Enregistrement W2800671298 · doi:10.1093/sleep/zsy061.119

0120 Emulating Human Sleep Spindle Scoring

2018· article· en· W2800671298 sur OpenAlexaffabout
Karine Lacourse, Jacques Delfrate, Julien Beaudry, Simon C. Warby

Notice bibliographique

RevueSLEEP · 2018
Typearticle
Langueen
DomainePsychology
ThématiqueSleep and Work-Related Fatigue
Établissements canadiensUniversité de MontréalCanadian Sleep & Circadian Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSleep spindleNon-rapid eye movement sleepFalse positive paradoxPolysomnographyGold standard (test)Computer scienceSleep (system call)Artificial intelligenceElectroencephalographyPattern recognition (psychology)PsychologyNeuroscienceEye movementMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Sleep spindles are a marker of stage 2 NREM sleep, have been linked to the process of learning & memory, and are altered by many neurological diseases. For human clinical polysomnography, the visual scoring of sleep spindles by human experts is generally considered the gold standard, but it is time-consuming, costly and can introduce inter/ra-scorer bias. Automated spindle detection methods are efficient and reproducible, but are not well-correlated with human scoring. Typically, automated detectors find large numbers of false positives (‘hidden spindles’) relative to human scorers. While it is plausible that the false positives are biologically meaningful, these ‘hidden spindles’ present several problems, including: i) Lack of gold standard for ‘hidden spindles’; ii) Lack of agreement between automated detectors for ‘hidden spindles’; iii) ‘Hidden spindles’ can be found throughout NREM, REM and wake, and therefore no longer are consistent with the original concept of the sleep spindle. To reduce the problem of ‘hidden spindles’, we have developed an automated spindle detector (‘A7’) that emulates how a human scores spindles. The ‘A7’ detector relies on the correlation/covariation of the sigma band-passed signal to the original broadband filtered (0.3-30Hz) EEG signal. To test the performance of the detector, we compared it against a gold standard spindle dataset derived from the consensus of a crowd-sourced group of human experts. The by-event performance of the ‘A7’ spindle detector was similar to individual experts (f1 score: 0.70 vs 0.67) against the consensus of a group of human experts. This was 0.17 points higher than other spindle detectors we tested. The ‘A7’ detector is designed to emulate human spindle scoring by minimizing the number of ‘hidden spindles’ detected and thereby detecting spindles that have the highest signal/noise ratio. We provide an open-source implementation of this detector for further use and testing. Funding for this work was provided by the Chaire Pfizer, Bristol-Myers Squibb, SmithKline Beecham, Eli Lilly en psychopharmacologie de l’ Université de Montréal, the Centre de Recherche Hôpital du Sacré-Coeur de Montréal, and the Canadian Institutes of Health Research (CIHR).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,509
Score d'incertitude au seuil0,995

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,005

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,344
Écart entre enseignants0,308 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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