Altered DNA methylation indicates an oscillatory flow mediated epithelial-to-mesenchymal transition signature in ascending aorta of patients with bicuspid aortic valve
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Disturbed flow has been suggested to contribute to aneurysm susceptibility in bicuspid aortic valve (BAV) patients. Lately, flow has emerged as an important modulator of DNA methylation. Hear we combined global methylation analysis with in vitro studies of flow-sensitive methylation to identify biological processes associated with BAV-aortopathy and the potential contribution of flow. Biopsies from non-dilated and dilated ascending aortas were collected from BAV (n = 21) and tricuspid aortic valve (TAV) patients (n = 23). DNA methylation and gene expression was measured in aortic intima-media tissue samples, and in EA.hy926 and primary aortic endothelial cells (ECs) isolated from BAV and TAV exposed to oscillatory (±12 dynes/cm2) or laminar (12 dynes/cm2) flow. We show methylation changes related to epithelial-mesenchymal-transition (EMT) in the non-dilated BAV aorta, associated with oscillatory flow related to endocytosis. The results indicate that the flow-response in BAV ECs involves hypomethylation and increased expression of WNT/β-catenin genes, as opposed to an angiogenic profile in TAV ECs. The EMT-signature was exasperated in dilated BAV aortas. Aberrant EMT in BAV aortic walls could contribute to increased aneurysm susceptibility, and may be due to disturbed flow-exposure. Perturbations during the spatiotemporally related embryonic development of ascending aorta and semilunar valves can however not be excluded.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».