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Enregistrement W2800773985 · doi:10.3389/fmicb.2018.01031

Arginine Catabolic Mobile Elements in Livestock-Associated Methicillin-Resistant Staphylococcal Isolates From Bovine Mastitic Milk in China

2018· article· en· W2800773985 sur OpenAlexafffund
Chao Tong, Zhaowei Wu, Xin Zhao, Huping Xue

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Microbiology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntimicrobial Resistance in Staphylococcus
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesRecruitment Program of Global ExpertsNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésMicrobiologyBiologyLivestockBovine milkFood scienceEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The arginine catabolic mobile element (ACME) facilitates colonization of staphylococci on skin and mucous membranes by improving their tolerances to polyamines and acidic conditions. ACME is inserted in tandem with the SCCmec element and S. epidermidis has been proposed to be a reservoir of ACME for other staphylococci. In this study, we investigated the existence of ACME in 146 staphylococcal isolates from mastitic milk and found 21 of them carried ACME. Almost half of the investigated S. epidermidis isolates contained the element. The whole genome of a S. epidermidis strain Y24 with ACME was further sequenced and the ACME-SCCmec composite island was assembled. This composite island is 81.3 kb long and consisted of 77 ORFs including a methicillin resistance gene mecA, a type II’ ACME gene cluster, a virulence gene pls and eight heavy metal tolerance genes. Wide existence of ACME in livestock-associated staphylococci from this study and a potential risk of spreading ACME among different staphylococcal species warrant close monitoring and further studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,023
Score d'incertitude au seuil0,046

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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