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Enregistrement W2800843942 · doi:10.1139/cjps-2017-0070

A 1-deoxy-<scp>d</scp>-xylulose 5-phosphate reductoisomerase gene probably involved in the synthesis of terpenoids in <i>Chrysanthemum indicum</i> var. <i>aromaticum</i>

2018· article· en· W2800843942 sur OpenAlexvenueno aff
Wenjie Gao, Xiang Wang, Nuananong Purente, Luqman Muhammad, Yunwei Zhou, Miao He

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Science · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant biochemistry and biosynthesis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesFundamental Research Funds for the Central UniversitiesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésTerpenoidMethyl jasmonateElicitorBiochemistryBiologyEnzymeChemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Terpenoids are important secondary metabolites in plants. The synthesis of terpenoids involves a key enzyme, 1-deoxy-d-xylulose 5-phosphate reductoisomerase (DXR). In an aromatic ornamental plant, Chrysanthemum indicum var. aromaticum, terpenoids were found to be an important component in leaf secretions. To study the regulatory mechanism of terpenoid synthesis in C. indicum var. aromaticum, we cloned the DXR gene from C. indicum var. aromaticum, named CiDXR, based on transcriptome data. CiDXR is 1419 bp, encoding a polypeptide chain of 472 amino acids. Comparative and bioinformatic analysis showed that CiDXR was highly similar to DXRs from other plant species. The protein product of CiDXR was analyzed for physical and chemical properties, and secondary and tertiary structures. Methyl jasmonate (MeJA) is an effective exogenous elicitor that can impact the synthesis of secondary metabolites by regulating the expression of a series of specific key enzymes. In our study, MeJA treatment was used to study the relationship between CiDXR expression and terpenoid metabolism. The expression pattern of CiDXR was analyzed by quantitative real-time polymerase chain reaction. Leaves expressed the highest level of CiDXR mRNA. In addition, CiDXR expression was found to be activated by MeJA, up to 20-fold at 24 h post induction. The MeJA treatment significantly affected the relative contents of the secretion products, and the induction effect was maximal at 24 h, consistent with the expression of CiDXR. This study shows that CiDXR may play a key regulatory role in the control of terpenoid synthesis in C. indicum var. aromaticum.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,680

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,207
Écart entre enseignants0,199 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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