MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2800864733 · doi:10.1016/j.ajhg.2018.03.011

Variants in EXOSC9 Disrupt the RNA Exosome and Result in Cerebellar Atrophy with Spinal Motor Neuronopathy

2018· article· en· W2800864733 sur OpenAlexaff
D T Burns, Sandra Donkervoort, Juliane Müller, Ellen Knierim, Diana Bharucha‐Goebel, Eissa Faqeih, Stephanie Bell, Abdullah Alfaifi, Dorota Monies, Francisca Millan, Kyle Retterer, Sarah Dyack, Sara MacKay, Susanne Morales-Gonzalez, Michele Giunta, Benjamin Munro, Gavin Hudson, Mena Scavina, Laura Baker, Tara Massini, Monkol Lek, Ying Hu, Daniel Ezzo, Fowzan S. Alkuraya, Peter B. Kang, Helen Griffin, A. Reghan Foley, Markus Schuelke, Rita Horváth, Carsten G. Bönnemann

Notice bibliographique

RevueThe American Journal of Human Genetics · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensIzaak Walton Killam Health CentreDalhousie University
Organismes subventionnairesNational Eye InstituteNational Heart, Lung, and Blood InstituteMedical Research CouncilEuropean Research CouncilNational Institutes of HealthNIH Clinical CenterMassachusetts Institute of TechnologyNewton FundKing Faisal Specialist Hospital and Research CentreBroad InstituteNational Human Genome Research InstituteWellcome TrustDeutsche ForschungsgemeinschaftNational Institute of Neurological Disorders and StrokeMassachusetts General Hospital
Mots-clésExosome complexRNAExosomeNeuroscienceSpinal muscular atrophyAtrophyBiologyMedicineGeneticsGeneNon-coding RNAMicrovesiclesmicroRNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

). We detected reduced EXOSC9 in fibroblasts and skeletal muscle and observed a reduction of the whole multi-subunit exosome complex on blue-native polyacrylamide gel electrophoresis. RNA sequencing of fibroblasts and skeletal muscle detected significant >2-fold changes in genes involved in neuronal development and cerebellar and motor neuron degeneration, demonstrating the widespread effect of the variants. Morpholino oligonucleotide knockdown and CRISPR/Cas9-mediated mutagenesis of exosc9 in zebrafish recapitulated aspects of the human phenotype, as they have in other zebrafish models of exosomal disease. Specifically, portions of the cerebellum and hindbrain were absent, and motor neurons failed to develop and migrate properly. In summary, we show that variants in EXOSC9 result in a neurological syndrome combining cerebellar atrophy and spinal motoneuronopathy, thus expanding the list of human exosomopathies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,940
Score d'incertitude au seuil0,280

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations94
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe American Journal of Human GeneticsMême sujetRNA Research and SplicingTravaux en français237 207