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Enregistrement W2800867381 · doi:10.1111/jse.12423

The spatial structure of phylogenetic and functional diversity in the United States and Canada: An example using the sedge family (Cyperaceae)

2018· article· en· W2800867381 sur OpenAlexafffundabout
Daniel Spalink, Jocelyn Pender, Marcial Escudero, Andrew L. Hipp, Eric H. Roalson, Julian R. Starr, Marcia J. Waterway, Lynn Bohs, Kenneth J. Sytsma

Notice bibliographique

RevueJournal of Systematics and Evolution · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueBotany, Ecology, and Taxonomy Studies
Établissements canadiensUniversity of OttawaMcGill UniversityAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesDivision of Environmental BiologyNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésCyperaceaePhylogenetic diversitySpecies richnessEcologyBiogeographyBiodiversityBiologyGamma diversityHerbariumGeographyPhylogenetic treeEcoregionAlpha diversityPoaceae

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Systematically quantifying diversity across landscapes is necessary to understand how clade history and ecological heterogeneity contribute to the origin, distribution, and maintenance of biodiversity. Here, we chart the spatial structure of diversity among all species in the sedge family (Cyperaceae) throughout the USA and Canada. We first identify areas of remarkable species richness, phylogenetic diversity, and functional trait diversity, and highlight regions of conservation priority. We then test predictions about the spatial structure of this diversity based on the historical biogeography of the family. Incorporating a phylogeny, over 400 000 herbarium records, and a database of functional traits mined from online floras, we find that species richness and functional trait diversity peak in the Northeastern USA, while phylogenetic diversity peaks along the Gulf of Mexico. Floristic turnover among assemblages increases significantly with distance, but phylogenetic turnover is twice as rapid along latitudinal gradients as along longitudinal gradients. These patterns reflect the expected distribution of Cyperaceae, which originated in the tropics but radiated in temperate regions. We identify assemblages with an abundance of rare, range‐restricted lineages, and assemblages composed of species generally lacking from diverse regions. We argue that both of these metrics are useful for developing targeted conservation strategies. We use the data generated here to establish future research priorities, including the testing of a series of hypotheses regarding the distribution of chromosome numbers, photosynthetic pathways, and resource partitioning in sedges.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,059

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0030,005
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,055
Tête enseignante GPT0,208
Écart entre enseignants0,153 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations40
Publié2018
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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