Enterovirus D68 in a community hospital: A test-negative case-control study
Notice bibliographique
Résumé
Background: In August 2014, a large North American outbreak of enterovirus D68 (EV-D68) was observed in association with severe respiratory illnesses in children as well as a possible association with acute flaccid paralysis. The full spectrum of clinical illness associated with EV-D68 is not well known. Objective: To compare children positive and negative for EV-D68 presenting to a community hospital during the North American outbreak in the fall of 2014. Methods: Consecutive nasopharyngeal swabs obtained from children (<18 years old) presenting to a large community hospital with respiratory symptoms in the fall of 2014 were tested for EV-D68. We conducted a test-negative case-control study between EV-D68 positive and EV-D68 negative children to describe the clinical and outcome characteristics. Controls were limited to children who had a nasopharyngeal swab obtained. EV-D68 indeterminate cases were excluded from the primary analysis. All nasopharyngeal swabs were referred to a reference laboratory for polymerase chain reaction testing and identification of EV-D68 through targeting the 5'NTR region and confirmed by amplifying the VP1 gene for serotype determination. Results: Of the 48 children tested there were 9 positive, 36 negative, and 3 indeterminate for EV-D68. Six of the 9 identified cases of EV-D68 were identified in the first week of testing (September 11–18, 2014). There were 35 children (78%) admitted to hospital for ≥1 day. EV-D68 infected children were significantly older (5.2 versus 2.5 years, p = 0.03). They were more likely to be concurrently taking asthma medications (44% versus 11%, p = 0.04) and receiving treatment with salbutamol (100% versus 58%, p = 0.02). There were no cases of severe respiratory distress or acute flaccid paralysis. Three EV-D68 infected children (33%) had viral co-infections identified. Conclusion: This study of a community hospital experience during the fall of 2014 demonstrates a series of mild illnesses from both EV-D68 positive and negative children. EV-D68 isolation was associated with age and asthmatic treatment in children.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».