New STs in multidrug-resistant <i>Acinetobacter baumannii</i> harbouring <i>β</i> -lactamases encoding genes isolated from Brazilian soils
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Aims We investigated the resistance profile, presence of β-lactamases encoding genes and the clonal relationships in Acinetobacter baumannii isolated from Brazilian soils. Methods and Results Soil isolates of A. baumannii were subjected to antimicrobial susceptibility testing by disk diffusion and minimum inhibitory concentration methods. Different β-lactamases encoding genes were screened by PCR and the molecular typing of these isolates was performed through the multilocus sequence typing. Non-susceptibility to different antibiotics was found, since environmental isolates were classified as multidrug-resistant. The blaSHV gene was the most prevalent, followed by blaGES. All sequence types (STs) found (ST1584, ST1607, ST1608, ST1609, ST1610, ST1611 and ST1612) were described for the first time in this study. Conclusion The wide variety of new alleles and new STs detected in the present study indicates a divergent population compared to studies that are carried out in the clinical environment and points to an even larger genetic diversity within the species than was anticipated. Significance and Impact of the Study A number of the environmental isolates represented multidrug-resistant strains, a phenotype that has been more commonly reported for clinical isolates of A. baumannii; the detection of several β-lactamase encoding genes in the investigated isolates is of great concern suggesting that there is a large reservoir of these resistance genes in the environment.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».