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Enregistrement W2801625460 · doi:10.1093/annonc/mdy126

Cytology cell blocks are suitable for immunohistochemical testing for PD-L1 in lung cancer

2018· article· en· W2801625460 sur OpenAlexafffund
H. Wang, Jason Agulnik, Goulnar Kasymjanova, A. Wang, Patricia Pérez Jiménez, V. Cohen, David Small, Carmela Pepe, Lama Sakr, Pierre Fiset, Manon Auger, Sophie Camilleri‐Broët, M. Alam El Din, George Chong, Léon C.L.T. van Kempen, Alan Spatz

Notice bibliographique

RevueAnnals of Oncology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Immunotherapy and Biomarkers
Établissements canadiensMcGill UniversityJewish General HospitalMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesFondation de l'Hôpital général juif
Mots-clésMedicineCytologyImmunohistochemistryLung cancerPathologyImmunostainingBiopsyFixativeCancerStainingInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: PD-L1 immunohistochemistry (IHC) testing is usually carried out on tissue blocks from core needle biopsy or surgical resections. In this study, we assessed the feasibility of using cytology cell blocks for PD-L1 IHC assay. Methods: A total of 1419 consecutive cases of non-small-cell lung cancer (NSCLC), including 371 cytology cell blocks, 809 small biopsies, and 239 surgical specimens, were included in the study. The cytology cell blocks were prepared with formalin only, methanol/alcohol only or both. PD-L1 expression was examined by staining with Dako PD-L1 IHC 22C3 pharmDx kit. A Tumor Proportion Score (TPS) was categorized as <1%, 1%-49% and ≥50% tumor cells. A total of 100 viable tumor cells were required for adequacy. Results: Of the cytology cell blocks, 92% of the specimens had an adequate number of tumor cells, not significantly different from small biopsies. The rate of TPS ≥50% differed between sample types and was observed in 42% of cytology cell blocks versus 36% of small biopsies (P = 0.04), and 29% of surgical resections (P = 0.001). The fixative methods did not affect the immunostaining, with overall PD-L1 high expression (TPS ≥50%) rates of 42% in formalin-fixed specimens versus 40% in specimens with combined fixation by methanol/alcohol and formalin (NS). The PD-L1 high expression rate was not associated with EGFR, ALK or KRAS molecular alterations. Higher stage (IV) was associated with higher PD-L1 TPS (P= 0.001). Conclusion: Our results show that when the TPS ≥50% is used as the end point, PD-L1 IHC performs well with cytology cell blocks. Cell blocks should be considered as a valuable resource for PD-L1 testing in advanced NSCLC. The clinical significance of higher PD-L1 IHC scores in cytology specimens needs to be evaluated prospectively.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,090
Tête enseignante GPT0,424
Écart entre enseignants0,335 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations111
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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