MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2801756079 · doi:10.1183/23120541.00170-2017

Predicting pulmonary tuberculosis in immigrants: a retrospective cohort study

2018· article· en· W2801756079 sur OpenAlexafffundabout
Courtney Heffernan, Alexander Doroshenko, Mary Lou Egedahl, J Barrié, Ambikaipakan Senthilselvan, Richard Long

Notice bibliographique

RevueERJ Open Research · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTuberculosis Research and Epidemiology
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesUniversity of Alberta
Mots-clésMedicineReceiver operating characteristicRetrospective cohort studyLogistic regressionTuberculosisCohortInternal medicineChest radiographArea under the curveDiseaseCohort studySurgeryPathologyLung

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Our objective was to investigate whether pulmonary tuberculosis (PTB) can be predicted from features of a targeted medical history and basic laboratory investigations in immigrants. A retrospective cohort of 391 foreign-born adults referred to the Edmonton Tuberculosis Clinic (Edmonton, AB, Canada) was studied using multiple logistic regression analysis to predict PTB. Seven characteristics of disease were used as explanatory variables. Cross-validation assessed performance. Each predictor was tested on two outcomes: “culture-positive” and “smear-positive”. Receiver operating characteristic (ROC) curves were generated and the area under the ROC curve (AUC) was quantified. Symptoms, subacute duration of symptoms, risk factors for reactivation of latent TB infection and anaemia were all associated with a positive culture (adjusted OR 1.79, 2.24, 1.72 and 2.28, respectively; p<0.05). Symptoms, inappropriate prescription of broad-spectrum antibiotics and a “typical” chest radiograph were associated with smear-positive PTB (adjusted OR 2.91, 1.55 and 12.34, respectively; p<0.05). ROC curve analysis was used to test each model, yielding AUC=0.91 for the outcome “culture-positive” disease and AUC=0.94 for the outcome “smear-positive” disease. PTB among the foreign-born can be predicted from a targeted medical history and basic laboratory investigations, raising the threshold of suspicion in settings where the disease is relatively rare.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil0,023

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,092
Tête enseignante GPT0,452
Écart entre enseignants0,360 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2018
Routes d'admission3
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueERJ Open ResearchMême sujetTuberculosis Research and EpidemiologyTravaux en français237 207