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Enregistrement W2802617351 · doi:10.3389/fgene.2018.00138

Molecular Identification of Shark Meat From Local Markets in Southern Brazil Based on DNA Barcoding: Evidence for Mislabeling and Trade of Endangered Species

2018· article· en· W2802617351 sur OpenAlexfundno aff
Fernanda Almerón-Souza, Christian Sperb, Carolina Leal de Castilho, Pedro Ivo C. C. Figueiredo, Leonardo Tresoldi Gonçalves, Rodrigo Machado, Larissa Rosa de Oliveira, Victor Hugo Valiati, Nelson J. R. Fagundes

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Genetics · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIdentification and Quantification in Food
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoUniversidade Federal do Rio Grande do SulFundação Grupo Boticário de Proteção à NaturezaMcGill University
Mots-clésDNA barcodingOverfishingEndangered speciesBiologyThreatened speciesFisheryPopulationZoologyEcologyFishing

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Elasmobranchs, the group of cartilaginous fishes that include sharks and rays, are especially vulnerable to overfishing due to low fecundity and late sexual maturation. A significant number of elasmobranch species are currently overexploited or threatened by fisheries activities. Additionally, several recent reports have indicated that there has been a reduction in regional elasmobranch population sizes. Brazil is an important player in elasmobranch fisheries and one of the largest importers of shark meat. However, carcasses entering the shark meat market have usually had their fins and head removed, which poses a challenge to reliable species identification based on the morphology of captured individuals. This is further complicated by the fact that the internal Brazilian market trades several different elasmobranch species under a common popular name: “cação”. The use of such imprecise nomenclature, even among governmental agencies, is problematic for both controlling the negative effects of shark consumption and informing the consumer about the origins of the product. In this study, we used DNA barcoding (mtDNA, COI gene) to identify, at the species level, "cação" samples available in local markets from Southern Brazil. We collected 63 samples traded as “cação”, which we found to correspond to 20 different species. These included two teleost species: Xiphias gladius (n=1) and Genidens barbus (n=6), and 18 species from seven elasmobranch orders (Carcharhiniformes, n=42; Squaliformes, n=3; Squatiniformes, n=2; Rhinopristiformes, n=4; Myliobatiformes, n=3; Rajiformes, n=1; and Torpediniformes, n=1). The most common species in our sample were Prionace glauca (n=15) and Sphyrna lewini (n=14), while all other species were represented by four samples or less. Considering IUCN criteria, 47% of the elasmobranch species found are threatened at the global level, while 53% are threatened and 47% are critically endangered in Brazil. These results underline that labelling the meat of any shark species as “cação” is problematic for monitoring catch allocations from the fishing industry and discourages consumer engagement in conservationist practices through informed decision-making.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,028
Score d'incertitude au seuil0,056

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,282
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations93
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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