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Enregistrement W2802640715 · doi:10.1002/jmv.25189

Transitioning cytomegalovirus viral load testing from a laboratory developed test to the cobas<sup>®</sup> CMV quantitative nucleic acid assay

2018· article· en· W2802640715 sur OpenAlexaff
Linda Merrick, Tanya Lawson, Gordon Ritchie, Christopher F. Lowe

Notice bibliographique

RevueJournal of Medical Virology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCytomegalovirus and herpesvirus research
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaProvidence Health Care
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésVirologyCytomegalovirusNucleic acidViral loadNucleic acid testCytomegalovirus infectionsBetaherpesvirinaeViral diseaseHerpesviridaeHuman cytomegalovirusVirusBiologyMedicineCoronavirus disease 2019 (COVID-19)BiochemistryPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Commutability between human cytomegalovirus (CMV) viral load assays (VLA) is poor, despite the development of a WHO CMV International Standard (CMV IS). We evaluated a new CMV VLA, cobas ® CMV, as compared to our current laboratory developed CMV VLA (LDT), for clinical use. Both the LDT and cobas ® CMV were run in parallel for 109 patient samples. In addition, 104 replicates, over 8 dilutions, of the CMV IS were tested. Conversion factors and correlation between the two assays were calculated. The correlation coefficient between the LDT and cobas ® CMV was 0.91 for patient samples. The Bland‐Altman graph displayed a systematic bias of +0.31 log 10 for the cobas ® CMV as compared to the LDT. The bias was greater for lower CMV viral loads. This increase in CMV viral loads was not seen with testing of the CMV IS dilutions by both the LDT and cobas ® CMV. CMV VLA inter‐assay commutability continues to be an issue when switching CMV testing platforms and requires communication between the laboratory and clinicians during the transition period to prevent misinterpretation of results.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,017
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,592
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,017
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,048
Tête enseignante GPT0,348
Écart entre enseignants0,300 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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