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Enregistrement W2802648553 · doi:10.1111/1755-0998.12889

Heritability of body size in the polar bears of Western Hudson Bay

2018· article· en· W2802648553 sur OpenAlexafffundabout
René M. Malenfant, Corey S. Davis, Evan S. Richardson, Nicholas J. Lunn, David W. Coltman

Notice bibliographique

RevueMolecular Ecology Resources · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMarine animal studies overview
Établissements canadiensEnvironment and Climate Change CanadaUniversity of AlbertaUniversity of New Brunswick
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaEnvironment and Climate Change CanadaGovernment of NunavutUniversity of AlbertaUniversity of New BrunswickWorld Wildlife Fund
Mots-clésBiologyHeritabilityUrsus maritimusGenetic architectureQuantitative trait locusGeneticsTraitGenetic variationSingle-nucleotide polymorphismCandidate geneEvolutionary biologyQuantitative geneticsGeneEcologyGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Among polar bears ( Ursus maritimus ), fitness is dependent on body size through males’ abilities to win mates, females’ abilities to provide for their young and all bears’ abilities to survive increasingly longer fasting periods caused by climate change. In the Western Hudson Bay subpopulation (near Churchill, Manitoba, Canada), polar bears have declined in body size and condition, but nothing is known about the genetic underpinnings of body size variation, which may be subject to natural selection. Here, we combine a 4449‐individual pedigree and an array of 5,433 single nucleotide polymorphisms ( SNP s) to provide the first quantitative genetic study of polar bears. We used animal models to estimate heritability ( h 2 ) among polar bears handled between 1966 and 2011, obtaining h 2 estimates of 0.34–0.48 for strictly skeletal traits and 0.18 for axillary girth (which is also dependent on fatness). We genotyped 859 individuals with the SNP array to test for marker–trait association and combined p ‐values over genetic pathways using gene‐set analysis. Variation in all traits appeared to be polygenic, but we detected one region of moderately large effect size in body length near a putative noncoding RNA in an unannotated region of the genome. Gene‐set analysis suggested that variation in body length was associated with genes in the regulatory cascade of cyclin expression, which has previously been associated with body size in mice. A greater understanding of the genetic architecture of body size variation will be valuable in understanding the potential for adaptation in polar bear populations challenged by climate change.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,012
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations63
Publié2018
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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