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Enregistrement W2802665995 · doi:10.3390/molecules23051014

Comparison of Serum Metabolite Changes of Radiated Mice Administered with Panax quinquefolium from Different Cultivation Regions Using UPLC-Q/TOF-MS Based Metabolomic Approach

2018· article· en· W2802665995 sur OpenAlexaboutno aff
Zhenxian Qin, Chan Jia, Dengqun Liao, Xiaofang Chen, Xianen Li

Notice bibliographique

RevueMolecules · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGinseng Biological Effects and Applications
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesChinese Academy of Medical Sciences Initiative for Innovative Medicine
Mots-clésMetabolomicsMetaboliteChemistryPharmacologyMetabolomeSignificant differenceTraditional medicineBiochemistryChromatographyBiologyMedicineInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Chemometric analysis of bioactive compounds revealed that American ginsengs (AGs) from different cultivation regions of China had a difference in quality, which indicates their possible pharmacological difference. A UPLC-Q/TOF-MS-based untargeted metabolomic approach was used to uncover serum metabolite changes in radiated mice pre-administered with AG root decoctions from seven cultivation regions and to further assess their quality difference. OPLS-DA revealed that 51 metabolites (ESI−) and 110 (ESI+) were differentially expressed in sera between the control and the radiated model mice. Heatmap analysis further revealed that AG could not reverse most of these radiation-altered metabolites, which indicates dietary supplement of AG before cobalt radiation had the weak potential to mediate serum metabolites that were altered by the sub-lethal high dose radiation. In addition, 83 (ESI−) and 244 (ESI+) AG altered metabolites were detected in radiated mice under radiation exposure. Both OPLS-DA on serum metabolomes and heatmap analysis on discriminant metabolites showed that AGs from different cultivation regions differentially influenced metabolic alterations in radiated mice, which indicates AGs from different cultivation regions showed the pharmacological difference in modulation of metabolite changes. AGs from Shandong, Shanxi, and Beijing provinces had more similar pharmacological effects than AGs from USA, Canada, Jilin, and Heilongjiang. Finally, 28 important potential biomarkers were annotated and assigned onto three metabolic pathways including lipid, amino acid, and energy metabolisms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,052
Score d'incertitude au seuil0,597

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,311
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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