Are there two species of Pygmy Shrews {Sorex)! Revisiting the question using DNA sequence data
Notice bibliographique
Résumé
Are there two species of Pygmy Shrews (Sorex)?Revisiting the question using DNA sequence data.Canadian Field-Naturalist 117(1): 82-88.Pygmy Shrews in North America have variously been considered to be one species (Sorex hoyi) or two species (S. hoyi and S. thompsoni).Currently, only S. hoyi is recognized.In this study, we examine mitochondrial DNA sequence data for the cytochrome b gene to evaluate the level of differentiation and phylogeographic relationships among eleven samples of Pygmy Shrews from across Canada.Pygmy Shrews from eastern Canada (i.e., Ontario, Quebec, New Brunswick, Nova Scotia, and Prince Edward Island) are distinct from Pygmy Shrews from western Canada (Alberta, Yukon) and Alaska.The average level of sequence divergence between these clades (3.3%) falls within the range of values for other recognized pairs of sister species of shrews.A molecular clock based on third position transversion substitutions suggests that these two lineages diverged between 0.44 and 1.67 million years ago.These molecular phylogenetic data, combined with a reinterpretation of previously published morphological data, are suggestive of separate species status for S. hoyi and S. thompsoni as has been previously argued by others.Further analysis of specimens from geographically intermediate areas (e.g., Manitoba, northern Ontario) is required to determine if there is secondary contact and/or introgression between these two putative species.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,003 |
| Communication savante | 0,001 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».