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Enregistrement W2803060420 · doi:10.3168/jds.2017-13940

The relationship between serum anti-Müllerian hormone concentrations and fertility, and genome-wide associations for anti-Müllerian hormone in Holstein cows

2018· article· en· W2803060420 sur OpenAlexafffundabout
M. Gobikrushanth, Deirdre C. Purfield, M.G. Colazo, S.T. Butler, Z. Wang, D.J. Ambrose

Notice bibliographique

RevueJournal of Dairy Science · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueReproductive Physiology in Livestock
Établissements canadiensAgriculture Food and Rural DevelopmentUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesUniversitat de LleidaAlberta Livestock and Meat AgencyTeagascUniversity of AlbertaAlberta InnovatesAlberta Agriculture and Forestry
Mots-clésAnti-Müllerian hormoneHerdBiologyPregnancyLactationFertilityDairy cattleArtificial inseminationInseminationAnimal scienceHormoneEndocrinologyMedicinePopulationGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The objectives of this study were to (1) evaluate factors associated with variation in circulating anti-Müllerian hormone (AMH) concentrations, (2) establish an optimum AMH threshold predictive of pregnancy to first artificial insemination (P/AI), (3) examine the relationship between AMH and fertility (P/AI, pregnancy loss between 30 and 60 d after artificial insemination, and pregnancy risk up to 250 d postpartum), and (4) identify quantitative trait loci associated with phenotypic variation of AMH concentrations in dairy cows. Serum AMH concentrations (pg/mL) were determined at 7 ± 2.4 d postpartum in 647 lactating Holstein cows (213 primiparous, 434 multiparous) from 1 research and 6 commercial dairy herds in Alberta, Canada. Of these, 589 cows were genotyped on the 26K Bovine BeadChip (Neogen Inc., Lincoln, NE) and subsequently imputed to the Illumina Bovine High Density BeadChip (Illumina, San Diego, CA) for genome-wide association analysis for variation in serum AMH concentrations. Factors associated with variation in serum AMH concentrations and the relationship between categories of AMH and aforementioned fertility outcomes were evaluated only in a subset of 460 cows that had a complete data set available. The overall mean (±standard error of the mean), median, minimum, and maximum AMH concentrations were 191.1 ± 6.3, 151.7, 13.9, and 1,879.0 pg/mL, respectively. The AMH concentrations were not associated with herd, precalving body condition score, postpartum week, and season of sampling; the lactation number, however, had a quadratic relationship with serum AMH concentrations (116.2, 204.9 204.5, and 157.9 pg/mL for first, second, third, and ≥fourth lactation, respectively). The optimum AMH threshold predictive of P/AI could not be established because the receiver operating characteristic curve analysis model was nonsignificant. Categories of AMH [low (<83.0 pg/mL; n = 92), intermediate (≥83.0 to ≤285.0 pg/mL; n = 276), and high (>285.0 pg/mL; n = 92) based on lowest 20%, intermediate 60%, and highest 20% serum AMH) had no associations with P/AI (34, 43, and 40%), pregnancy loss between 30 and 60 d after artificial insemination (20, 12, and 8%), or pregnancy risk up to 250 d postpartum. One candidate gene associated with AMH production [AMH gene on Bos taurus autosome (BTA) 7] and 4 candidate genes related to embryo development (SCAI and PPP6C genes on BTA11 and FGF18 and EEF2K genes on BTA20 and BTA25, respectively) were in linkage disequilibrium with single nucleotide polymorphisms associated with phenotypic variation in serum AMH in dairy cows.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesÉtudes des sciences et des technologies
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,335
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,051
Tête enseignante GPT0,284
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations48
Publié2018
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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