Impact of the griffithsin anti-HIV microbicide and placebo gels on the rectal mucosal proteome and microbiome in non-human primates
Notice bibliographique
Résumé
Topical microbicides are being explored as an HIV prevention method for individuals who practice receptive anal intercourse. In vivo studies of these microbicides are critical to confirm safety. Here, we evaluated the impact of a rectal microbicide containing the antiviral lectin, Griffithsin (GRFT), on the rectal mucosal proteome and microbiome. Using a randomized, crossover placebo-controlled design, six rhesus macaques received applications of hydroxyethylcellulose (HEC)- or carbopol-formulated 0.1% GRFT gels. Rectal mucosal samples were then evaluated by label-free tandem MS/MS and 16 S rRNA gene amplicon sequencing, for proteomics and microbiome analyses, respectively. Compared to placebo, GRFT gels were not associated with any significant changes to protein levels at any time point (FDR < 5%), but increased abundances of two common and beneficial microbial taxa after 24 hours were observed in HEC-GRFT gel (p < 2E-09). Compared to baseline, both placebo formulations were associated with alterations to proteins involved in proteolysis, activation of the immune response and inflammation after 2 hours (p < 0.0001), and increases in beneficial Faecalibacterium spp. after 24 hours in HEC placebo gel (p = 4.21E-15). This study supports the safety profile of 0.1% GRFT gel as an anti-HIV microbicide and demonstrates that current placebo formulations may associate with changes to rectal proteome and microbiota.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».