MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2803330505 · doi:10.1016/j.dib.2018.05.128

Data on leukocyte PDZK1 deficiency affecting macrophage apoptosis but not monocyte recruitment, cell proliferation, macrophage abundance or ER stress in atherosclerotic plaques of LDLR deficient mice

2018· article· en· W2803330505 sur OpenAlexafffund
Pei Yu, Alexander S. Qian, Kevin M. Chathely, Bernardo L. Trigatti

Notice bibliographique

RevueData in Brief · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCytokine Signaling Pathways and Interactions
Établissements canadiensHamilton Health SciencesMcMaster UniversityThrombosis and Atherosclerosis Research Institute
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchChina Scholarship CouncilHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésUnfolded protein responseTunicamycinLDL receptorBiologyMacrophageMacrophage polarizationMonocyteCell biologyInflammationApoptosisCancer researchImmunologyEndocrinologyEndoplasmic reticulumCholesterolLipoproteinBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PDZK1 (Post-synaptic density protein/Drosophila disc-large protein/Zonula occludens protein containing 1) is an adaptor protein that binds to the HDL receptor, Scavenger receptor class B type I. Leukocyte PDZK1 deficiency in high fat-diet fed LDL receptor knockout mice has been found to increase atherosclerotic necrotic core formation and apoptosis of cells within atherosclerotic plaques. To explore mechanisms that may be involved, we examined the effects of leukocyte PDZK1 deficiency in mice on a number of processes that may impact macrophage abundance within atherosclerotic plaques. We found that leukocyte PDZK1 deficiency in high fat diet fed LDL receptor knockout mice did not affect the abundance of circulating red blood cells, myeloid cells or B- or T-lymphocytes. Leukocyte selective PDZK1 deficiency did not affect the levels of the ER chaperone proteins, detected with an antibody against the KDEL peptide, in macrophages or macrophage abundance, cellular proliferation or monocyte recruitment in atherosclerotic plaques. Leukocyte PDZK1 deficiency in otherwise wild type mice did result in increased sensitivity of macrophages to tunicamycin-induced apoptosis in a peritonitis model. HDL protected wild type macrophages from apoptosis induced by a variety of agents, including the ER stressor tunicamycin, oxidized LDL and exposure to UV irradiation. However, this protection afforded by HDL was lost when macrophages were deficient in PDZK1. HDL did not affect the level of ER stress induction by tunicamycin. Finally, PDZK1 deficiency in macrophages did not affect lipopolysaccharide-mediated induction of markers of M1 polarization. These data, utilizing mouse and cellular models, help to demonstrate that leukocyte PDZK1 plays a role in atherosclerosis by affecting macrophage apoptosis within atherosclerotic plaques.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,151
Tête enseignante GPT0,363
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueData in BriefMême sujetCytokine Signaling Pathways and InteractionsTravaux en français237 207