Distinct biomarker signatures in HIV acute infection associate with viral dynamics and reservoir size
Notice bibliographique
Résumé
Estimating the size of the viral reservoir is critical for HIV cure strategies. Biomarkers in peripheral circulation may give insights into the establishment of the viral reservoir in compartments not easily accessible. We therefore measured systemic levels of 84 soluble biomarkers belonging to a broad array of immune pathways in acute HIV infection in both antiretroviral therapy-naive (ART-naive) individuals as well as individuals who began ART upon early detection of HIV infection. These biomarkers were measured longitudinally during acute and chronic infection and their relationship to viral reservoir establishment and persistence was assessed. We observed several distinct biomarker pathways induced following HIV infection such as IFN-γ-signaled chemokines, proinflammatory markers, and TNF-α-family members. Levels of several of these factors directly correlated with contemporaneous viral loads and/or frequency of peripheral blood mononuclear cells harboring HIV DNA during acute HIV infection. MCP-1, MIP-3β, sTNFR-II, and IL-10 levels prior to ART associated with HIV DNA levels after 96 weeks of treatment, suggesting a link between early immune signaling events and the establishment and persistence of the viral reservoir during ART. Furthermore, they offer potentially novel tools for gaining insight into relative reservoir size in acutely infected individuals and the potential of associated risks of treatment interruption.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».