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Enregistrement W2803394617 · doi:10.1093/icesjms/fsx214

From Thoreau’s woods to the Canary Islands: exploring ocean biogeochemistry through enzymology

2017· article· en· W2803394617 sur OpenAlexaboutno aff
Theodore T. Packard

Notice bibliographique

RevueICES Journal of Marine Science · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueOcean Acidification Effects and Responses
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesH2020 European Research CouncilUniversidad de Las Palmas de Gran Canaria
Mots-clésOceanographyBiogeochemistryBiogeochemical cycleNitrate reductasePhytoplanktonUpwellingNitrateSeawaterCarbon cycleEnvironmental scienceEcosystemChemistryEnvironmental chemistryEcologyBiologyGeologyNutrient

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract This essay relates my odyssey in exploring enzyme reactions as oceanographic rate proxies and describes my scientific contributions since 1963. To elucidate biogeochemical processes in marine ecosystems I explored calculating respiratory oxygen utilization (OUR) and nitrate respiration from activities of the respiratory electron transport system (ETS), assimilatory phytoplankton nitrate uptake from nitrate reductase activity, and respiratory CO2 production from isocitrate dehydrogenase. This exploration began at Woods Hole Oceanographic Institute doing a thesis on Krebs-Cycle-based respiration in the quahog, Venus mercenaria, for my B.Sc. at the Massachusetts Institute of Technology (MIT). It continued at the Friday Harbor Marine Laboratory (FHL) of the University of Washington (UW) developing a biological oceanography MS thesis testing succinate dehydrogenase activity as a respiration proxy in Artemia salina. Upon realizing that the ETS, not the Krebs-Cycle, controlled the electron flux to O2, I developed the ETS idea to determine seawater OUR for a Ph.D. thesis at UW. The resulting assay led to the first direct measurements of deep-sea metabolism and allowed biochemical calculations of OUR profiles in the Costa Rica Dome, in the Peru upwelling, and in other ocean water columns. I continued this research at Maine’s Bigelow Laboratory for Ocean Science (BLOS), and at Quebec’s Institute Maurice Lamontagne (IML). Then, after moving to Spain, I used the stability of my pension to continue this research at the University of Las Palmas de Gran Canaria (ULPGC) where I am catalysing new thinking about ocean metabolism. Here, these topics are integrated into an autobiographic history of this science.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,116
Score d'incertitude au seuil0,689

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0020,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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