Complete plastome sequence of <i>Dracaena cambodiana</i> (Asparagaceae): a species considered “Vulnerable” in Southeast Asia
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Notice bibliographique
Résumé
Dracaena cambodiana (Asparagaceae) is a treelike plant ranging from 3 to 10 m tall. It grows in low-elevation forests (0–300 m) having dry and sandy soils. It is distributed in Southern Hainan Island in China and other Southeast Asian countries (e.g. Cambodia, Laos, Thailand and Vietnam). The dried resin can be used medicinally as a substitute for that of Dracaena cochinchinensis. It has been ranked as a Vulnerable (VU) species in China. Here we report and characterize the complete plastid genome sequence of D. cambodiana. The complete plastome is 156,697 bp in length. It contains the typical structure and gene content of angiosperm plastomes, including two Inverted Repeat (IR) regions of 26,526 bp, a Large Single-Copy (LSC) region of 84,988 bp and a Small Single-Copy (SSC) region of 18,657 bp. The plastome contains 113 genes, consisting of 76 unique protein-coding genes, 30 unique tRNA genes, four unique rRNA genes and three pseudogenes (i.e. matK, infA, ndhF). The overall A/T content in the plastome of D. cambodiana is 62.4%. We performed phylogenetic analyses using the entire plastome, including spacers, introns, etc., and we determined that D. cambodiana and Maianthemum bicolor were closely related. The complete plastome sequence of D. cambodiana will provide a useful resource for the conservation genetics of this species as well as for phylogenetic studies in Asparagales.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle