Fluctuations in populations of subsurface methane oxidizers in coordination with changes in electron acceptor availability
Notice bibliographique
Résumé
The concentrations of electron donors and acceptors in the terrestrial subsurface biosphere fluctuate due to migration and mixing of subsurface fluids, but the mechanisms and rates at which microbial communities respond to these changes are largely unknown. Subsurface microbial communities exhibit long cellular turnover times and are often considered relatively static-generating just enough ATP for cellular maintenance. Here, we investigated how subsurface populations of CH4 oxidizers respond to changes in electron acceptor availability by monitoring the biological and geochemical composition in a 1339 m-below-land-surface (mbls) fluid-filled fracture over the course of both longer (2.5 year) and shorter (2-week) time scales. Using a combination of metagenomic, metatranscriptomic, and metaproteomic analyses, we observe that the CH4 oxidizers within the subsurface microbial community change in coordination with electron acceptor availability over time. We then validate these findings through a series of 13C-CH4 laboratory incubation experiments, highlighting a connection between composition of subsurface CH4 oxidizing communities and electron acceptor availability.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».