<i>MLH1</i> Promoter Methylation and Prediction/Prognosis of Gastric Cancer: A Systematic Review and Meta and Bioinformatic Analysis
Notice bibliographique
Résumé
Background: The promoter methylation of MLH1 gene and gastric cancer (GC)has been investigated previously.To get a more credible conclusion, we performed a systematic review and meta and bioinformatic analysis to clarify the role of MLH1 methylation in the prediction and prognosis of GC.Methods: Eligible studies were targeted after searching the PubMed, Web of Science, Embase, BIOSIS, CNKI and Wanfang Data to collect the information of MLH1 methylation and GC.The link strength between the two was estimated by odds ratio with its 95% confidence interval.The Newcastle-Ottawa scale was used for quantity assessment.Subgroup and sensitivity analysis were conducted to explore sources of heterogeneity.The Gene Expression Omnibus (GEO) and The Cancer Genome Atlas (TCGA) were employed for bioinformatics analysis on the correlation between MLH1 methylation and GC risk, clinicopathological behavior as well as prognosis.Results: 2365 GC and 1563 controls were included in the meta-analysis.The pooled OR of MLH1 methylation in GC was 4.895 (95% CI: 3.149-7.611,P<0.001), which considerably associated with increased GC risk.No significant difference was found in relation to Lauren classification, tumor invasion, lymph node/distant metastasis and tumor stage in GC.Analysis based on GEO and TCGA showed that high MLH1 methylation enhanced GC risk but might not related with GC clinicopathological features and prognosis.Conclusion: MLH1 methylation is an alive biomarker for the prediction of GC and it might not affect GC behavior.Further study could be conducted to verify the impact of MLH1 methylation on GC prognosis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,008 | 0,016 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,010 | 0,020 |
| Bibliométrie | 0,007 | 0,009 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».