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Enregistrement W2804192500 · doi:10.24908/iqurcp.8940

Functional investigation of a highly conserved aspartate residue in the anti -cancer drug efflux transport protein MRP1

2018· article· en· W2804192500 sur OpenAlexvenueno aff
Graeme Mullins

Notice bibliographique

RevueInquiry Queen s Undergraduate Research Conference Proceedings · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDrug Transport and Resistance Mechanisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésATP-binding cassette transporterEffluxAmino acidTransmembrane domainMutantBiologyBiochemistryTransmembrane proteinMutant proteinMutagenesisCytoplasmABCC1Membrane proteinMultidrug Resistance-Associated ProteinsTransport proteinTransporterGeneMembrane

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Multidrug Resistant Protein 1 (MRP1 or ABCC1) belongs to a subclass of ATP-binding cassette (ABC) transporters that export a wide range of metabolites and xenobiotics across the plasma membrane. Increased expression of MRP1 in cancer cells enhances efflux of many anti-cancer agents, giving rise to multidrug resistant tumours. The purpose of this study was to investigate the function of an aspartate (Asp) amino acid that is highly conserved in all MRP-related proteins by mutating it and determining the consequences of doing so. Asp430 lies at the interface of the cytoplasm and a transmembrane helix in the first membrane-spanning domain of MRP1. Previous studies have shown that when Asp430 is mutated, the protein becomes unstable and is degraded.Because this Asp430 is highly conserved in many MRP-related ABC transporters and because structural homology models of human MRP1 predict that Asp430 is in close proximity to Arg433, we hypothesized that a salt bridge between these two a mino acids could be essential for proper folding and stability of the protein during its biosynthesis. Using site -directed mutagenesis, these two amino acids were interchanged to probe the existence of such an interaction. Thus a double mutant where Asp430 was mutated to Arg, and Arg433 was mutated to Asp was created, and the resultant mutant protein (D430R/R433D) was tested for its ability to be detected in mammalian cells by gel electrophoresis and immunoblotting. Our results show differences between the migration patterns of double and single mutants that are compatible with differences in the glycosylation levels of MRP1. However the fact that D430R and the R433D mutants don’t share the same migration pattern, together with the variation in migration bet ween D430 wild type and Supported by CIHR MOP-10519the double mutant D430R/R433D indicate that the possibility of a salt bridge can be discarded.Supported by CIHR MOP-10519

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,110
Tête enseignante GPT0,351
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
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Résumé présentoui

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