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Enregistrement W2804199370 · doi:10.1097/pas.0000000000001082

A 3-Protein Expression Signature of Neuroblastoma for Outcome Prediction

2018· article· en· W2804199370 sur OpenAlexaff
Yi Xie, Hua Xu, Fang Fang, Zhiheng Li, Huiting Zhou, Jian Pan, Wanliang Guo, Xueming Zhu, Jian Wang, Yi Wu

Notice bibliographique

RevueThe American Journal of Surgical Pathology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeuroblastoma Research and Treatments
Établissements canadiensPediatric Oncology Group
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGanglioneuroblastomaGanglioneuromaProliferating cell nuclear antigenImmunohistochemistryNeuroblastomaTissue microarrayOncologyMedicineReceiver operating characteristicProliferation MarkerInternal medicinePathologyCancer researchBiologyCell culture

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Neuroblastoma (NB) is the most common extracranial solid tumor in children with contrasting outcomes. Precise risk assessment contributes to prognosis prediction, which is critical for treatment strategy decisions. In this study, we developed a 3-protein predictor model, including the neural stem cell marker Msi1, neural differentiation marker ID1, and proliferation marker proliferating cell nuclear antigen (PCNA), to improve clinical risk assessment of patients with NB. Kaplan-Meier analysis in the microarray data (GSE16476) revealed that low expression of ID1 and high expression of Msi1 and PCNA were associated with poor prognosis in NB patients. Combined application of these 3 markers to constitute a signature further stratified NB patients into different risk subgroups can help obtain more accurate prediction performance. Survival prognostic power of age and Msi1_ID1_PCNA signature by receiver operating characteristics analysis showed that this signature predicted more effectively and sensitively compared with classic risk stratification system, compensating for the deficiency of the prediction function of the age. Furthermore, we validated the expressions of these 3 proteins in neuroblastic tumor spectrum tissues by immunohistochemistry revealed that Msi1 and PCNA exhibited increased expression in NB compared with intermedial ganglioneuroblastoma and benign ganglioneuroma, whereas ID1 levels were reduced in NB. In conclusion, we established a robust risk assessment predictor model based on simple immunohistochemistry for therapeutic decisions of NB patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,396
Score d'incertitude au seuil0,297

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,327
Écart entre enseignants0,304 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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