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Enregistrement W2804365806

High Resolution Fluorescence Imaging of Cell Membranes and Membrane Associated Interactions

2007· preprint· en· W2804365806 sur OpenAlexaff
Herbert Schneckenburger, Michael Wagner, Petra Weber, Henri‐Pierre Lassalle, Wolfgang S. L. Strauß

Notice bibliographique

RevueHAL (Le Centre pour la Communication Scientifique Directe) · 2007
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced Fluorescence Microscopy Techniques
Établissements canadiensCentre d'expertise et de recherche en infrastructures urbaines
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMembraneChemistryFörster resonance energy transferTotal internal reflection fluorescence microscopeBiophysicsFluorescence microscopeMembrane fluidityFluorescence-lifetime imaging microscopyLaurdanFluorescenceAnalytical Chemistry (journal)OpticsBiochemistryChromatographyBiologyPhysics
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Advanced methods of fluorescence microscopy with micrometre - nanometre resolution are described. Wide-field and laser scanning techniques are used to measure fluorescence markers in whole cells including intracellular membranes. In contrast, plasma membranes of living cells are assessed selectively by the evanescent electromagnetic field in Total Internal Reflection Fluorescence Microscopy (TIRFM). TIRFM methods permit to measure cell-substrate topology as well as non-radiative intermolecular energy transfer (FRET) with nanometre resolution. Membrane dynamics – including membrane stiffness and fluidity – is assessed by spectral imaging and time-resolved fluorescence anisotropy measurements of the membrane marker 6-dodecanoyl-2-dimethylamino naphthalene (laurdan). Stiffness increases while fluidity decreases with increasing temperature as well as with an increasing intracellular amount of cholesterol. In addition, plasma membranes are always stiffer than intracellular membranes and retain their stiffness even after cholesterol depletion. This behavior may have some impact on the cellular uptake and release of pharmaceutical agents. Cell-substrate topology is measured by variable-angle TIRFM using fluorescent dyes with specific location either in the cytoplasm (e.g. calcein) or in the plasma membrane (e.g. laurdan). Due to its tumor-localizing and photosensitizing properties, measurements of protoporphyrin IX PP IX) in close proximity to the plasma membrane are of particular interest. It turned out that cell-substrate distances generally decreased, whereas focal adhesions were maintained upon light exposure. This implies that light-induced detachment of cells from their substrate was not likely to occur. Total internal reflection fluorescence microscopy (TIRFM) and non-radiative energy transfer (FRET) measurements have been combined in order to examine co-localization and possible interactions of various proteins, e.g. the amyloid precursor protein (APP) and the b-site APP-cleaving enzyme (BACE), which play some role in the pathogenesis of Alzheimer's disease. Both proteins were found in close proximity inside the cells and at some larger distance in the plasma membrane. A high amount of cholesterol was favourable for co-localization. The examples depicted above prove the potential of fluorescence microscopy with high spatial, temporal and spectral resolution.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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