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Enregistrement W2804414244 · doi:10.1016/j.stem.2018.05.001

Exit from Naive Pluripotency Induces a Transient X Chromosome Inactivation-like State in Males

2018· article· en· W2804414244 sur OpenAlexfundno aff
Elsa Sousa, Hannah T. Stuart, Lawrence E. Bates, Mohammadmersad Ghorbani, Jennifer Nichols, Sabine Dietmann, José Silva

Notice bibliographique

RevueCell stem cell · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCRISPR and Genetic Engineering
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesFundação para a Ciência e a TecnologiaMedical Research CouncilMedical Research Council CanadaWellcome Trust
Mots-clésXISTBiologyX-inactivationHomeobox protein NANOGEpiblastX chromosomeGeneticsChromatinDosage compensationEmbryonic stem cellGene silencingCell biologyGeneInduced pluripotent stem cellGastrulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A hallmark of naive pluripotency is the presence of two active X chromosomes in females. It is not clear whether prevention of X chromosome inactivation (XCI) is mediated by gene networks that preserve the naive state. Here, we show that robust naive pluripotent stem cell (nPSC) self-renewal represses expression of Xist, the master regulator of XCI. We found that nPSCs accumulate Xist on the male X chromosome and on both female X chromosomes as they become NANOG negative at the onset of differentiation. This is accompanied by the appearance of a repressive chromatin signature and partial X-linked gene silencing, suggesting a transient and rapid XCI-like state in male nPSCs. In the embryo, Xist is transiently expressed in males and in females from both X chromosomes at the onset of naive epiblast differentiation. In conclusion, we propose that XCI initiation is gender independent and triggered by destabilization of naive identity, suggesting that gender-specific mechanisms follow, rather than precede, XCI initiation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,715

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations46
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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