An ABCA4 loss-of-function mutation causes a canine form of Stargardt disease
Notice bibliographique
Résumé
Autosomal recessive retinal degenerative diseases cause visual impairment and blindness in both humans and dogs.Currently, no standard treatment is available, but pioneering gene therapy-based canine models have been instrumental for clinical trials in humans.To study a novel form of retinal degeneration in Labrador retriever dogs with clinical signs indicating cone and rod degeneration, we used whole-genome sequencing of an affected sibpair and their unaffected parents.A frameshift insertion in the ATP binding cassette subfamily A member 4 (ABCA4) gene (c.4176insC),leading to a premature stop codon in exon 28 (p.F1393Lfs*1395), was identified.In contrast to unaffected dogs, no full-length ABCA4 protein was detected in the retina of an affected dog.The ABCA4 gene encodes a membrane transporter protein localized in the outer segments of rod and cone photoreceptors.In humans, the ABCA4 gene is associated with Stargardt disease (STGD), an autosomal recessive retinal degeneration leading to central visual impairment.A hallmark of STGD is the accumulation of lipofuscin deposits in the retinal pigment epithelium (RPE).The discovery of a canine homozygous ABCA4 loss-of-function mutation may advance the development of dog as a large animal model for human STGD. Author summaryStargardt disease (STGD) is the most common inherited retinal disease causing visual impairment and blindness in children and young adults, affecting 1 in 8-10 thousand people.For other inherited retinal diseases, the dog has become an established comparative animal model, both for identifying the underlying genetic causes and for developing new
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».