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Enregistrement W2804667349 · doi:10.4238/gmr16039916

Research Article Genetic expression of pobA and fabHB in Bacillus licheniformis M2-7 in the presence of benzo[a]pyrene

2018· article· en· W2804667349 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueGenetics and Molecular Research · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial bioremediation and biosurfactants
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesConsejo Nacional de Ciencia y Tecnología
Mots-clésBacillus licheniformisPyreneChemistryBenzo(a)pyreneFood scienceMolecular biologyBiologyGeneticsOrganic chemistryBacillus subtilisBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bacillus licheniformis M2-7 is a heat-resistant bacterium able to biotransform polycyclic aromatic hydrocarbons. It can transform a wide range of these compounds as naphthalene, phenanthrene, pyrene and benzo[a]pyrene. Benzo[a]pyrene is a polycyclic aromatic hydrocarbon of high molecular weight considered as potentially toxic and carcinogenic for humans. Aiming to discover the genes involved in the biotransformation of benzo[a]pyrene, we made a B. licheniformis M2-7 genomic library in E. coli. We isolated two E. coli strains that were able to grow in minimal salt medium supplemented with benzo[a]pyrene. From the analysis of the DNA fragments in the clones H23 and H38, we identified open reading frames coding for 5 possible genes, among them pobA and fabHB, which products are the enzymes 4hydroxybenzoate 3-monooxygenase and the ketoacyl-ACP synthase Genetics and Molecular Research 17 (2): gmr16039916 III, respectively. To evaluate the role of these genes in the metabolism of benzo[a]pyrene in B. licheniformis M2-7, we estimated their relative expression through reverse transcription quantitative PCR. Finally, we observed that the genes pobA and fabHB were overexpressed after 3 h under induction with benzo[a]pyrene, suggesting that this strain could use these genes during the metabolism of this PAH, plus it does it in a faster time than that reported for other bacterial genera Key words: 4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase (pobA); Ketoacyl-ACP synthase III (fabHB); Bacillus licheniformis M2-7; benzo[a]pyrene; Reverse transcription quantitative (PCR)

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,188
Score d'incertitude au seuil0,385

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,335
Écart entre enseignants0,297 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle