Research Article Genetic expression of pobA and fabHB in Bacillus licheniformis M2-7 in the presence of benzo[a]pyrene
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Notice bibliographique
Résumé
Bacillus licheniformis M2-7 is a heat-resistant bacterium able to biotransform polycyclic aromatic hydrocarbons. It can transform a wide range of these compounds as naphthalene, phenanthrene, pyrene and benzo[a]pyrene. Benzo[a]pyrene is a polycyclic aromatic hydrocarbon of high molecular weight considered as potentially toxic and carcinogenic for humans. Aiming to discover the genes involved in the biotransformation of benzo[a]pyrene, we made a B. licheniformis M2-7 genomic library in E. coli. We isolated two E. coli strains that were able to grow in minimal salt medium supplemented with benzo[a]pyrene. From the analysis of the DNA fragments in the clones H23 and H38, we identified open reading frames coding for 5 possible genes, among them pobA and fabHB, which products are the enzymes 4hydroxybenzoate 3-monooxygenase and the ketoacyl-ACP synthase Genetics and Molecular Research 17 (2): gmr16039916 III, respectively. To evaluate the role of these genes in the metabolism of benzo[a]pyrene in B. licheniformis M2-7, we estimated their relative expression through reverse transcription quantitative PCR. Finally, we observed that the genes pobA and fabHB were overexpressed after 3 h under induction with benzo[a]pyrene, suggesting that this strain could use these genes during the metabolism of this PAH, plus it does it in a faster time than that reported for other bacterial genera Key words: 4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase (pobA); Ketoacyl-ACP synthase III (fabHB); Bacillus licheniformis M2-7; benzo[a]pyrene; Reverse transcription quantitative (PCR)
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle