MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2804722407 · doi:10.1371/journal.pone.0197074

Multi-site evaluation of the LN34 pan-lyssavirus real-time RT-PCR assay for post-mortem rabies diagnostics

2018· article· en· W2804722407 sur OpenAlex
Crystal M. Gigante, Lisa Dettinger, James Powell, Melanie Seiders, Rene Edgar Condori, Richard Griesser, Kenneth Okogi, Maria P. Carlos, Kendra Pesko, Mike Breckenridge, Edson Michael M. Simon, Maria Yna Joyce Chu, April Davis, Scott Brunt, Lillian A. Orciari, Pamela A. Yager, William Carson, Claire Hartloge, Jeremiah T. Saliki, Susan Sánchez, Mojgan Deldari, Kristina Hsieh, Ashutosh Wadhwa, Kimberly Wilkins, Veronica Yung Peredo, Patricia Rabideau, Nina Gruhn, Rolain Cadet, Shrikrishna Isloor, Sujith S Nath, Tomy Joseph, Jinxin Gao, Ryan M. Wallace, Mary G. Reynolds, Victoria A. Olson, Yu Li

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueRabies epidemiology and control
Établissements canadiensMinistry of Agriculture
Organismes subventionnairesOak Ridge Institute for Science and EducationCenters for Disease Control and PreventionCalifornia Department of Public HealthPennsylvania Department of HealthU.S. Department of Energy
Mots-clésLyssavirusRabiesGold standard (test)VirologyRabies virusDirect fluorescent antibodyBiologyMultiplexMedicineRhabdoviridaeAntibodyImmunologyBioinformaticsInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Rabies is a fatal zoonotic disease that requires fast, accurate diagnosis to prevent disease in an exposed individual. The current gold standard for post-mortem diagnosis of human and animal rabies is the direct fluorescent antibody (DFA) test. While the DFA test has proven sensitive and reliable, it requires high quality antibody conjugates, a skilled technician, a fluorescence microscope and diagnostic specimen of sufficient quality. The LN34 pan-lyssavirus real-time RT-PCR assay represents a strong candidate for rabies post-mortem diagnostics due to its ability to detect RNA across the diverse Lyssavirus genus, its high sensitivity, its potential for use with deteriorated tissues, and its simple, easy to implement design. Here, we present data from a multi-site evaluation of the LN34 assay in 14 laboratories. A total of 2,978 samples (1,049 DFA positive) from Africa, the Americas, Asia, Europe, and the Middle East were tested. The LN34 assay exhibited low variability in repeatability and reproducibility studies and was capable of detecting viral RNA in fresh, frozen, archived, deteriorated and formalin-fixed brain tissue. The LN34 assay displayed high diagnostic specificity (99.68%) and sensitivity (99.90%) when compared to the DFA test, and no DFA positive samples were negative by the LN34 assay. The LN34 assay produced definitive findings for 80 samples that were inconclusive or untestable by DFA; 29 were positive. Five samples were inconclusive by the LN34 assay, and only one sample was inconclusive by both tests. Furthermore, use of the LN34 assay led to the identification of one false negative and 11 false positive DFA results. Together, these results demonstrate the reliability and robustness of the LN34 assay and support a role for the LN34 assay in improving rabies diagnostics and surveillance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,379
Score d'incertitude au seuil0,889

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,073
Tête enseignante GPT0,292
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle