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Enregistrement W2804823779 · doi:10.1139/cjfr-2018-0084

Root-associated fungi of <i>Pinus wallichiana</i> in Kashmir Himalaya

2018· article· en· W2804823779 sur OpenAlexvenueno aff
Sumira Tyub, Azra N. Kamili, Zafar A. Reshi, Irfan Rashid, Taseem A. Mokhdomi, Shoiab Bukhari, Asif Amin, Asrar H. Wafai, Raies A. Qadri

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Forest Research · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueMycorrhizal Fungi and Plant Interactions
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMinistry of Environment, Forest and Climate ChangeMinistry of Environment
Mots-clésBiologyBotanyInternal transcribed spacerSpecies richnessEcologyRibosomal RNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

An important factor in the performance of out-planted conifers is the association of plant roots with ectomycorrhizal (EcM) fungi. However, limited information is available about the diversity of root-associated EcM fungi of Pinus wallichiana A.B. Jackson, a coniferous species endemic to Himalayan forests that has hampered the reforestation programs in the area. The study was carried at three major forest areas of the Kashmir Himalaya believed to be pure stands of P. wallichiana. Fine root tips harbouring EcM fungi were collected and processed for extraction of fungal DNA, which was subsequently subjected to ITS rDNA targeted PCR–RFLP profiling. DNA sequencing analysis of the overlapping ITS amplifications followed by global nucleotide BLAST analyses of the assembled nuclear ribosomal DNA (rDNA) revealed a total of 33 fungal taxa associated with P. wallichiana of which 23 species were EcM fungi. Of the 10 non-EcM fungi, we found a peculiar saprophytic wood decaying fungus, Chalara microchona, associated with P. wallichiana for the first time. The study not only reveals the species richness of fungi associated with this conifer but also documents new fungal associations with it, which have not been reported so far. The results in the study set a baseline for the broad association of ectomycorrhizal fungi with P. wallichiana, which may serve as guiding cue to design reforestation programs in the Kashmir Himalaya.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,035
Score d'incertitude au seuil0,070

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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