Science AMA Series: This is Chris Deeg of the University of British Columbia (Canada). I do research on Giant Viruses that infect microscopic organisms and I’m here today to talk about it. AMA!
Notice bibliographique
Résumé
hi reddit! I’m a graduate student in Curtis Suttle’s lab at the University of British Columbia (Canada) where our research focuses on aquatic microbiology. I study pathogens that infect protists – microscopic organisms living in aquatic environments. Amongst them are Giant Viruses that have challenged concepts of what constitutes a virus due to their enormous size and complexity. My research aims to explore the diversity and environmental role of these overlooked viruses. Further, I am interested in the evolutionary processes that have led to Giant Viruses reaching a complexity comparable to cellular organisms. In a recent paper published in the journal eLife, my colleagues and I isolated and characterized the giant Bodo saltans virus (BsV) that infects the protist Bodo saltans. Sequencing the genome of BsV revealed many previously unknown genes, a putative mechanism for genome expansion, and several unusual features, such as movable genetic elements that might help to fend off other Giant Viruses by cutting their genomes. You can read a plain-language summary of our findings. I’m here to answer questions related to our eLife paper or our research more broadly. I’ll start answering questions at 1pm EDT. AMA!
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,019 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,006 | 0,012 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,001 |
| Communication savante | 0,005 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,003 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,136 | 0,170 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».