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Enregistrement W2805343326 · doi:10.1002/humu.23557

Severe neurocognitive and growth disorders due to variation in <i>THOC2</i>, an essential component of nuclear mRNA export machinery

2018· article· en· W2805343326 sur OpenAlexafffund
Raman Kumar, Alison Gardner, Claire C. Homan, Evelyn Douglas, Heather C. Mefford, Dagmar Wieczorek, Hermann‐Josef Lüdecke, Zornitza Stark, Simon Sadedin, C. Nowak, Jessica Douglas, Gretchen Parsons, Paul R. Mark, Lourdes Loidi, Gail E. Herman, Theresa Mihalic Mosher, Meredith Gillespie, Lauren Brady, Mark A. Tarnopolsky, Irene Madrigal, Jesús Manuel Eirís Puñal, Laura Domènech, Raquel Rabionet, Tim M. Strom, Naoko Ishihara, Hidehito Inagaki, Hiroki Kurahashi, Tracy Dudding‐Byth, Elizabeth E. Palmer, Michael Field, Jozef Gécz

Notice bibliographique

RevueHuman Mutation · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensMcMaster University Medical CentreChildren's Hospital of Eastern OntarioUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNational Eye InstituteNational Human Genome Research InstituteNational Health and Medical Research CouncilMinisterio de Economía y CompetitividadNational Heart, Lung, and Blood InstituteOntario Genomics InstituteChannel 7 Children's Research FoundationGénome QuébecCanadian Institutes of Health ResearchGenome CanadaChildren's Hospital of Eastern Ontario FoundationOntario Genomics
Mots-clésBiologyMissense mutationNuclear export signalGeneticsPhenotypeNeurocognitiveRNA splicingIntellectual disabilityGeneNeuroscienceCell nucleusRNACognition

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Highly conserved TREX-mediated mRNA export is emerging as a key pathway in neuronal development and differentiation. TREX subunit variants cause neurodevelopmental disorders (NDDs) by interfering with mRNA export from the cell nucleus to the cytoplasm. Previously we implicated four missense variants in the X-linked THOC2 gene in intellectual disability (ID). We now report an additional six affected individuals from five unrelated families with two de novo and three maternally inherited pathogenic or likely pathogenic variants in THOC2 extending the genotypic and phenotypic spectrum. These comprise three rare missense THOC2 variants that affect evolutionarily conserved amino acid residues and reduce protein stability and two with canonical splice-site THOC2 variants that result in C-terminally truncated THOC2 proteins. We present detailed clinical assessment and functional studies on a de novo variant in a female with an epileptic encephalopathy and discuss an additional four families with rare variants in THOC2 with supportive evidence for pathogenicity. Severe neurocognitive features, including movement and seizure disorders, were observed in this cohort. Taken together our data show that even subtle alterations to the canonical molecular pathways such as mRNA export, otherwise essential for cellular life, can be compatible with life, but lead to NDDs in humans.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,946
Score d'incertitude au seuil0,276

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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